A conditional piggyBac transposition system for genetic screening in mice identifies oncogenic networks in pancreatic cancer

生物 插入突变 胰腺癌 遗传学 癌症 癌症研究 转移 基因 计算生物学 癌变 基因组
作者
Roland Rad,Lena Rad,Wei Wang,Alexander Strong,Hannes Ponstingl,Iraad F. Bronner,Matthew Mayho,Katja Steiger,Julia Weber,Maren Hieber,Christian Veltkamp,Stefan Eser,Ulf Geumann,Rupert Öllinger,Magdalena Żukowska,Maxim Barenboim,Roman Maresch,Juan Cadiñanos,Mathias Friedrich,Ignacio Varela,Fernando Constantino‐Casas,Aaron L. Sarver,Jelle ten Hoeve,Haydn M. Prosser,Barbara Seidler,Judith Bauer,Mathias Heikenwälder,Emmanouil Metzakopian,Anne Krug,Ursula Ehmer,Günter Schneider,Thomas Knösel,Petra Rümmele,Daniela E. Aust,Robert Grützmann,Christian Pilarsky,Zemin Ning,Lodewyk F.A. Wessels,Roland M. Schmid,Michael A. Quail,George S. Vassiliou,Iréne Esposito,Pentao Liu,Dieter Saur,Allan Bradley
出处
期刊:Nature Genetics [Nature Portfolio]
卷期号:47 (1): 47-56 被引量:77
标识
DOI:10.1038/ng.3164
摘要

Here we describe a conditional piggyBac transposition system in mice and report the discovery of large sets of new cancer genes through a pancreatic insertional mutagenesis screen. We identify Foxp1 as an oncogenic transcription factor that drives pancreatic cancer invasion and spread in a mouse model and correlates with lymph node metastasis in human patients with pancreatic cancer. The propensity of piggyBac for open chromatin also enabled genome-wide screening for cancer-relevant noncoding DNA, which pinpointed a Cdkn2a cis-regulatory region. Histologically, we observed different tumor subentities and discovered associated genetic events, including Fign insertions in hepatoid pancreatic cancer. Our studies demonstrate the power of genetic screening to discover cancer drivers that are difficult to identify by other approaches to cancer genome analysis, such as downstream targets of commonly mutated human cancer genes. These piggyBac resources are universally applicable in any tissue context and provide unique experimental access to the genetic complexity of cancer.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
molihuakai应助爱笑念芹采纳,获得10
刚刚
1秒前
1秒前
1秒前
鸡翅公主发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
2秒前
Yuuuan发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
阿洁发布了新的文献求助10
2秒前
科研通AI2S应助漂亮的傲白采纳,获得10
2秒前
3秒前
Ava应助犹豫的大碗采纳,获得10
3秒前
科研通AI6.4应助urologywang采纳,获得30
3秒前
领导范儿应助冷酷小天鹅采纳,获得10
3秒前
3秒前
晚风发布了新的文献求助30
3秒前
4秒前
4秒前
zs发布了新的文献求助10
4秒前
haha发布了新的文献求助10
4秒前
万能图书馆应助鲤鱼访天采纳,获得10
4秒前
佟佳霖发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
5秒前
糖卜里卜发布了新的文献求助10
6秒前
小刀发布了新的文献求助10
6秒前
chi完成签到,获得积分10
7秒前
张家璐发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
7秒前
大胆妖精完成签到,获得积分10
7秒前
8秒前
JohnLemon发布了新的文献求助10
8秒前
yuki发布了新的文献求助10
8秒前
president发布了新的文献求助10
9秒前
CodeCraft应助tomorrow采纳,获得10
9秒前
爆金币选手完成签到,获得积分10
9秒前
9秒前
ekun完成签到,获得积分10
10秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
The anomeric effect 1314
Principles of town planning: translating concepts to applications 1000
Navigating Normative Orders. Interdisciplinary Perspectives 800
1 Peter and Christ's Descent to the Dead in Its Early Christian Reception 700
Organizational Behavior 510
Management and the Arts 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7737739
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9286899
关于积分的说明 20180676
捐赠科研通 7315529
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3305633
关于科研通互助平台的介绍 2457870
邀请新用户注册赠送积分活动 2315317