A conditional piggyBac transposition system for genetic screening in mice identifies oncogenic networks in pancreatic cancer

生物 插入突变 胰腺癌 遗传学 癌症 癌症研究 转移 基因 计算生物学 癌变 基因组
作者
Roland Rad,Lena Rad,Wei Wang,Alexander Strong,Hannes Ponstingl,Iraad F. Bronner,Matthew Mayho,Katja Steiger,Julia Weber,Maren Hieber,Christian Veltkamp,Stefan Eser,Ulf Geumann,Rupert Öllinger,Magdalena Żukowska,Maxim Barenboim,Roman Maresch,Juan Cadiñanos,Mathias Friedrich,Ignacio Varela,Fernando Constantino‐Casas,Aaron L. Sarver,Jelle ten Hoeve,Haydn M. Prosser,Barbara Seidler,Judith Bauer,Mathias Heikenwälder,Emmanouil Metzakopian,Anne Krug,Ursula Ehmer,Günter Schneider,Thomas Knösel,Petra Rümmele,Daniela E. Aust,Robert Grützmann,Christian Pilarsky,Zemin Ning,Lodewyk F.A. Wessels,Roland M. Schmid,Michael A. Quail,George S. Vassiliou,Iréne Esposito,Pentao Liu,Dieter Saur,Allan Bradley
出处
期刊:Nature Genetics [Nature Portfolio]
卷期号:47 (1): 47-56 被引量:77
标识
DOI:10.1038/ng.3164
摘要

Here we describe a conditional piggyBac transposition system in mice and report the discovery of large sets of new cancer genes through a pancreatic insertional mutagenesis screen. We identify Foxp1 as an oncogenic transcription factor that drives pancreatic cancer invasion and spread in a mouse model and correlates with lymph node metastasis in human patients with pancreatic cancer. The propensity of piggyBac for open chromatin also enabled genome-wide screening for cancer-relevant noncoding DNA, which pinpointed a Cdkn2a cis-regulatory region. Histologically, we observed different tumor subentities and discovered associated genetic events, including Fign insertions in hepatoid pancreatic cancer. Our studies demonstrate the power of genetic screening to discover cancer drivers that are difficult to identify by other approaches to cancer genome analysis, such as downstream targets of commonly mutated human cancer genes. These piggyBac resources are universally applicable in any tissue context and provide unique experimental access to the genetic complexity of cancer.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
传奇3的应助被samxie采纳,获得10
刚刚
一颗盐完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
1秒前
Yuan88发布了新的文献求助10
1秒前
谢杭呈发布了新的文献求助10
1秒前
kaio_escolar的应助被xiangxuehai8采纳,获得10
2秒前
2秒前
3秒前
yuyu发布了新的文献求助10
3秒前
3秒前
华仔的应助被专一的弱采纳,获得10
4秒前
woojiay完成签到,获得积分10
4秒前
Yuan88发布了新的文献求助10
4秒前
SciGPT的应助被FuuKa采纳,获得10
5秒前
lxq发布了新的文献求助10
5秒前
qika发布了新的文献求助30
5秒前
5秒前
6秒前
王一g完成签到,获得积分10
6秒前
过冷水的应助被云山万重采纳,获得20
7秒前
orixero的应助被威武的皮卡丘采纳,获得10
8秒前
yeyeye完成签到,获得积分10
8秒前
8秒前
芥丶子发布了新的文献求助10
9秒前
129发布了新的文献求助10
9秒前
9秒前
9秒前
Yuan88发布了新的文献求助10
9秒前
华仔的应助被ss采纳,获得10
10秒前
LJD完成签到,获得积分10
10秒前
maer发布了新的文献求助10
10秒前
yeyeye发布了新的文献求助10
11秒前
胡侃完成签到,获得积分10
11秒前
踏实的绣连完成签到 ,获得积分10
11秒前
12秒前
12秒前
12秒前
13秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis, 14 Volume Set, 2nd Edition(本书共14册,本求助8volume-14volume共7册,独立harcover版本,非网络版本e-EROS 版,不能网络版转化PDF或提取PDF) 2000
Essentials of Carbohydrate Chemistry and Biochemistry, 4th Edition 1000
Электротехническая система магнитожидкостной герметизации валов регулируемых электродвигателей 800
日本語と中国語及びチベット・ビルマ語の語源関連性に関する分析 800
Practical Manual of Forensic Psychophysiology: Methodology, Execution, and Fields of Application 800
Holistic Discourse Analysis, Second Edition by Robert E. Longacre 666
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 计算机科学 工程类 纳米技术 有机化学 物理 生物化学 化学工程 内科学 复合材料 催化作用 心理学 人工智能 细胞生物学 光电子学 无机化学 量子力学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7962718
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9433127
关于积分的说明 21020575
捐赠科研通 7540823
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3371296
关于科研通互助平台的介绍 2506878
邀请新用户注册赠送积分活动 2403770