A conditional piggyBac transposition system for genetic screening in mice identifies oncogenic networks in pancreatic cancer

生物 插入突变 胰腺癌 遗传学 癌症 癌症研究 转移 基因 计算生物学 癌变 基因组
作者
Roland Rad,Lena Rad,Wei Wang,Alexander Strong,Hannes Ponstingl,Iraad F. Bronner,Matthew Mayho,Katja Steiger,Julia Weber,Maren Hieber,Christian Veltkamp,Stefan Eser,Ulf Geumann,Rupert Öllinger,Magdalena Żukowska,Maxim Barenboim,Roman Maresch,Juan Cadiñanos,Mathias Friedrich,Ignacio Varela,Fernando Constantino‐Casas,Aaron L. Sarver,Jelle ten Hoeve,Haydn M. Prosser,Barbara Seidler,Judith Bauer,Mathias Heikenwälder,Emmanouil Metzakopian,Anne Krug,Ursula Ehmer,Günter Schneider,Thomas Knösel,Petra Rümmele,Daniela E. Aust,Robert Grützmann,Christian Pilarsky,Zemin Ning,Lodewyk F.A. Wessels,Roland M. Schmid,Michael A. Quail,George S. Vassiliou,Iréne Esposito,Pentao Liu,Dieter Saur,Allan Bradley
出处
期刊:Nature Genetics [Nature Portfolio]
卷期号:47 (1): 47-56 被引量:77
标识
DOI:10.1038/ng.3164
摘要

Here we describe a conditional piggyBac transposition system in mice and report the discovery of large sets of new cancer genes through a pancreatic insertional mutagenesis screen. We identify Foxp1 as an oncogenic transcription factor that drives pancreatic cancer invasion and spread in a mouse model and correlates with lymph node metastasis in human patients with pancreatic cancer. The propensity of piggyBac for open chromatin also enabled genome-wide screening for cancer-relevant noncoding DNA, which pinpointed a Cdkn2a cis-regulatory region. Histologically, we observed different tumor subentities and discovered associated genetic events, including Fign insertions in hepatoid pancreatic cancer. Our studies demonstrate the power of genetic screening to discover cancer drivers that are difficult to identify by other approaches to cancer genome analysis, such as downstream targets of commonly mutated human cancer genes. These piggyBac resources are universally applicable in any tissue context and provide unique experimental access to the genetic complexity of cancer.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
suodeheng完成签到,获得积分10
刚刚
李李发布了新的文献求助10
刚刚
包容元芹发布了新的文献求助10
刚刚
刚刚
1秒前
yxy发布了新的文献求助10
1秒前
大鱼大鱼完成签到,获得积分10
1秒前
科研通AI6.4的应助被碎觉觉采纳,获得10
1秒前
1秒前
陈操完成签到,获得积分20
2秒前
wfwl发布了新的文献求助10
2秒前
3秒前
4秒前
LYQ关闭了LYQ的文献求助
5秒前
Ava的应助被科研通管家采纳,获得10
6秒前
深情安青的应助被科研通管家采纳,获得10
6秒前
思源的应助被科研通管家采纳,获得10
6秒前
小二郎的应助被科研通管家采纳,获得10
6秒前
田様的应助被科研通管家采纳,获得10
6秒前
敏感的熊猫完成签到 ,获得积分10
6秒前
6秒前
woodenfish完成签到,获得积分10
7秒前
Ding-Ding发布了新的文献求助10
7秒前
吕如音发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
XX的应助被失眠水风采纳,获得10
7秒前
xj305完成签到,获得积分10
8秒前
i3utter发布了新的文献求助10
8秒前
科研通AI2S的应助被kk采纳,获得10
8秒前
9秒前
9秒前
Jasper的应助被包容元芹采纳,获得30
9秒前
小鸿完成签到,获得积分10
10秒前
月亮发布了新的文献求助10
10秒前
科研通AI6.2的应助被mascot采纳,获得10
11秒前
刘瀚臻发布了新的文献求助10
11秒前
11秒前
思源的应助被chengyou采纳,获得10
12秒前
春桑早点睡完成签到,获得积分10
13秒前
14秒前
高分求助中
(应助此贴封号)通过应助OA文献获取积分 10000
Rosenblum, Global Change Biology 800
Yugoslavia and China Histories, Legacies, Afterlives 560
A Silent Apostrophe:The Fayum Portraits 520
Organizational Behavior 510
AI-Contracting 300
四川大学学位论文.郭瑞昂. 基于高压热扩散的n型磷掺杂金刚石半导体制备研究 300
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 计算机科学 工程类 纳米技术 有机化学 化学工程 内科学 物理 生物化学 复合材料 催化作用 细胞生物学 人工智能 心理学 无机化学 基因 遗传学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7836036
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9358362
关于积分的说明 20604510
捐赠科研通 7428839
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3337990
关于科研通互助平台的介绍 2482350
邀请新用户注册赠送积分活动 2359016