Subjective data models in bioinformatics and how wet lab and computational biologists conceptualise data

计算机科学 元数据 背景(考古学) 数据科学 计算模型 生物学数据 大数据 标识符 过程(计算) 软件 编码(集合论) 任务(项目管理) 万维网 数据挖掘 生物信息学 人工智能 程序设计语言 管理 集合(抽象数据类型) 经济 古生物学 生物
作者
Yo Yehudi,Lukas Hughes-Noehrer,Carole Goble,Caroline Jay
出处
期刊:Scientific Data [Nature Portfolio]
卷期号:10 (1) 被引量:1
标识
DOI:10.1038/s41597-023-02627-9
摘要

Biological science produces "big data" in varied formats, which necessitates using computational tools to process, integrate, and analyse data. Researchers using computational biology tools range from those using computers for communication, to those writing analysis code. We examine differences in how researchers conceptualise the same data, which we call "subjective data models". We interviewed 22 people with biological experience and varied levels of computational experience, and found that many had fluid subjective data models that changed depending on circumstance. Surprisingly, results did not cluster around participants' computational experience levels. People did not consistently map entities from abstract data models to the real-world entities in files, and certain data identifier formats were easier to infer meaning from than others. Real-world implications: 1) software engineers should design interfaces for task performance, emulating popular user interfaces, rather than targeting professional backgrounds; 2) when insufficient context is provided, people may guess what data means, whether or not they are correct, emphasising the importance of contextual metadata to remove the need for erroneous guesswork.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
医学完成签到,获得积分10
1秒前
cdragon完成签到,获得积分10
1秒前
2秒前
悠悠小土豆完成签到,获得积分10
2秒前
Yuuuuu完成签到,获得积分10
2秒前
4秒前
ymu发布了新的文献求助10
5秒前
bingbingsha完成签到 ,获得积分10
6秒前
TengMa发布了新的文献求助20
6秒前
11完成签到,获得积分10
6秒前
4344发布了新的文献求助10
7秒前
8秒前
9秒前
汉堡包应助昆明官渡酒店采纳,获得10
10秒前
霜月完成签到,获得积分10
10秒前
科研通AI6.2应助Theta采纳,获得30
11秒前
11秒前
冷泠凛应助Niko采纳,获得200
12秒前
taowang发布了新的文献求助30
13秒前
雨过天青发布了新的文献求助30
13秒前
务实弘文完成签到 ,获得积分10
14秒前
lyk666完成签到,获得积分10
15秒前
16秒前
17秒前
小聖发布了新的文献求助20
18秒前
CH3N完成签到,获得积分10
18秒前
落寞的虔发布了新的文献求助10
19秒前
20秒前
21秒前
多少完成签到,获得积分10
23秒前
七之发布了新的文献求助10
23秒前
ymu完成签到,获得积分10
25秒前
毅逸发布了新的文献求助10
25秒前
Victory发布了新的文献求助10
26秒前
AcA发布了新的文献求助10
27秒前
banwenmi给banwenmi的求助进行了留言
27秒前
可心X发布了新的文献求助10
28秒前
传奇3应助滴滴滴123采纳,获得10
29秒前
EasonHong完成签到,获得积分10
29秒前
32秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Chemistry and Physics of Carbon Volume 18 800
The Organometallic Chemistry of the Transition Metals 800
The formation of Australian attitudes towards China, 1918-1941 640
Signals, Systems, and Signal Processing 610
全相对论原子结构与含时波包动力学的理论研究--清华大学 500
Elevating Next Generation Genomic Science and Technology using Machine Learning in the Healthcare Industry Applied Machine Learning for IoT and Data Analytics 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 物理 内科学 复合材料 催化作用 物理化学 光电子学 电极 细胞生物学 基因 无机化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6443673
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8257473
关于积分的说明 17587196
捐赠科研通 5502394
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2900959
邀请新用户注册赠送积分活动 1877987
关于科研通互助平台的介绍 1717534