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Deciphering the chemical constituents and antimicrobial activity of Prangos pabularia Lindl. using LC-MS/MS in combination with experimental evaluation and computational studies

抗菌剂 生物信息学 蜡样芽孢杆菌 化学 白色念珠菌 体外 对接(动物) 计算生物学 大肠杆菌 光滑假丝酵母 微生物学 生物 生物化学 细菌 遗传学 医学 护理部 基因
作者
Aadil Yaseen,Bashir Ahmad Sheikh,Basharat Bhat,Saima Hamid,Malik A. Waseem,Mohammed Iqbal Zargar,Manzoor Ahmad Mir,Wajaht A. Shah
出处
期刊:Natural Product Research [Taylor & Francis]
卷期号:: 1-6
标识
DOI:10.1080/14786419.2023.2300394
摘要

This study meticulously explores the antimicrobial potential of Prangos pabularia Lindl.’s aerial parts through a comprehensive blend of in vitro and in silico analysis. Extracts with varying polarities underwent LC-MS/MS identification of active components, followed by in vitro and in silico assessments of antimicrobial efficacy against Escherichia coli, Bacillus cereus, Candida albicans, Candida glabrata, and Candida paropsilosis. The methanolic extract exhibited significant antimicrobial activity with a MIC value of 48 μg/mL against all tested strains. Molecular docking revealed the compound 9-(3-methylbut-2-enoxy)-furo-(3,2-g)-chromen-7-one’s highest binding affinity against the penicillin-binding protein (PBP) bacterial drug target molecule. Other compounds also displayed substantial interactions with key antimicrobial drug target proteins. Further, Molecular dynamics simulations affirmed the stability of protein and ligand conformations. Collectively, these results underscore Prangos pabularia Lindl.’s aerial parts as a promising botanical resource in combating diverse microbial infections. This comprehensive approach not only validates it’s in vitro antimicrobial properties but also provides molecular insights into interaction mechanisms, advancing our comprehension of the plant’s therapeutic potential.

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