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Co-culturing microbial consortia: approaches for applications in biomanufacturing and bioprocessing

生物制造 生物过程 生化工程 有可能 合成生物学 计算机科学 代谢工程 生物 生物生产 生物技术 生物反应器 纳米技术 计算生物学 工程类 古生物学 材料科学 心理治疗师 心理学
作者
Rahul Vijay Kapoore,Gloria Padmaperuma,Supattra Maneein,Seetharaman Vaidyanathan
出处
期刊:Critical Reviews in Biotechnology [Informa]
卷期号:42 (1): 46-72 被引量:31
标识
DOI:10.1080/07388551.2021.1921691
摘要

The application of microbial co-cultures is now recognized in the fields of biotechnology, ecology, and medicine. Understanding the biological interactions that govern the association of microorganisms would shape the way in which artificial/synthetic co-cultures or consortia are developed. The ability to accurately predict and control cell-to-cell interactions fully would be a significant enabler in synthetic biology. Co-culturing method development holds the key to strategically engineer environments in which the co-cultured microorganism can be monitored. Various approaches have been employed which aim to emulate the natural environment and gain access to the untapped natural resources emerging from cross-talk between partners. Amongst these methods are the use of a communal liquid medium for growth, use of a solid-liquid interface, membrane separation, spatial separation, and use of microfluidics systems. Maximizing the information content of interactions monitored is one of the major challenges that needs to be addressed by these designs. This review critically evaluates the significance and drawbacks of the co-culturing approaches used to this day in biotechnological applications, relevant to biomanufacturing. It is recommended that experimental results for a co-cultured species should be validated with different co-culture approaches due to variations in interactions that could exist as a result of the culturing method selected.
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