Characterization of diverse Cas9 orthologs for genome and epigenome editing

清脆的 基因组编辑 Cas9 生物 计算生物学 表观基因组 遗传学 核酸酶 CRISPR干扰 流动遗传元素 反式激活crRNA 基因组 质粒 基因 DNA甲基化 基因表达
作者
Gabriel L. Butterfield,Dahlia Rohm,Avery Roberts,Matthew A. Nethery,Anthony Rizzo,Daniel J. Morone,Lisa Garnier,Nahid Iglesias,Rodolphe Barrangou,Charles A. Gersbach
出处
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proceedings of the National Academy of Sciences]
卷期号:122 (11)
标识
DOI:10.1073/pnas.2417674122
摘要

CRISPR-Cas9 systems have revolutionized biotechnology, creating diverse new opportunities for biomedical research and therapeutic genome and epigenome editing. Despite the abundance of bacterial CRISPR-Cas9 systems, relatively few are effective in human cells, limiting the overall potential of CRISPR technology. To expand the CRISPR-Cas toolbox, we characterized a set of type II CRISPR-Cas9 systems from select bacterial genera and species encoding diverse Cas9s. Four systems demonstrated robust and specific gene repression in human cells when used as nuclease-null dCas9s fused with a KRAB domain and were also highly active nucleases in human cells. These systems have distinct protospacer adjacent motifs (PAMs), including AT-rich motifs and sgRNA features orthogonal to the commonly used Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes Cas9s. Additionally, we assessed gene activation when fused with the p300 catalytic domain. Notably, S. uberis Cas9 performed competitively against benchmarks with promising repression, activation, nuclease, and base editing activity. This study expands the CRISPR-Cas9 repertoire, enabling effective genome and epigenome editing for diverse applications.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
lhc完成签到,获得积分10
刚刚
llliiiku发布了新的文献求助10
1秒前
liguanyu1078完成签到,获得积分10
2秒前
admire发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
Orange应助carbon采纳,获得10
3秒前
啦啦啦完成签到,获得积分20
3秒前
LL完成签到,获得积分10
3秒前
4秒前
4秒前
5秒前
沈海完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
刘颖元发布了新的文献求助10
6秒前
xss完成签到 ,获得积分10
7秒前
7秒前
7秒前
Nakjeong完成签到 ,获得积分10
7秒前
慕青应助抚仙采纳,获得10
8秒前
慕青应助万物更始采纳,获得10
9秒前
隐形曼青应助hipig采纳,获得10
11秒前
苹果完成签到,获得积分10
11秒前
jin发布了新的文献求助10
11秒前
zyj完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
admire完成签到,获得积分10
13秒前
苏苏发布了新的文献求助10
13秒前
刘颖元完成签到,获得积分10
14秒前
llliiiku完成签到,获得积分20
14秒前
16秒前
20秒前
liu17330579092完成签到,获得积分10
21秒前
21秒前
卡拉蹦蹦完成签到,获得积分20
22秒前
22秒前
田様应助xss采纳,获得10
23秒前
24秒前
ZeSheng完成签到,获得积分10
25秒前
莫离完成签到 ,获得积分10
25秒前
抚仙发布了新的文献求助10
25秒前
高分求助中
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 3000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 1000
Structural Load Modelling and Combination for Performance and Safety Evaluation 1000
Conference Record, IAS Annual Meeting 1977 820
England and the Discovery of America, 1481-1620 600
電気学会論文誌D(産業応用部門誌), 141 巻, 11 号 510
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 物理化学 催化作用 量子力学 光电子学 冶金
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3572505
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3142644
关于积分的说明 9448520
捐赠科研通 2844063
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1563224
邀请新用户注册赠送积分活动 731661
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 718667