In silico identification of novel heterocyclic compounds combats Alzheimer’s disease through inhibition of butyrylcholinesterase enzymatic activity

丁酰胆碱酯酶 生物信息学 化学 鉴定(生物学) 药理学 胆碱酯酶 计算生物学 生物化学 乙酰胆碱酯酶 阿切 医学 生物 植物 基因
作者
Hai Duc Nguyen
出处
期刊:Journal of Biomolecular Structure & Dynamics [Informa]
卷期号:42 (20): 10890-10910 被引量:1
标识
DOI:10.1080/07391102.2023.2259482
摘要

Increasing evidence indicates that heterocyclic molecules possess properties against butyrylcholinesterase (BChE) enzymatic activity, which is a potential therapeutic target for Alzheimer's disease (AD). Thus, this study aimed to further evaluate the relationship between heterocyclic molecules and their biological activities. A dataset of 38 selective and potent heterocyclic compounds (-log[the half‑maximal inhibitory concentration (pIC50)]) values ranging from 8.02 to 10.05) was applied to construct a quantitative structure-activity relationship (QSAR) study, including Bayesian model average (BMA), artificial neural network (ANN), multiple nonlinear regression (MNLR), and multiple linear regression (MLR) models. Four models met statistical acceptance in internal and external validation. The ANN model was superior to other models in predicting the pIC50 of the outcome. The descriptors put into the models were found to be comparable with the target-ligand complex X-ray structures, making these models interpretable. Three selected molecules possess drug-like properties (pIC50 values ranged from 9.19 to 9.54). The docking score between candidates and the BChE receptor (RCSB ID 6EYF) ranged from -8.4 to -9.0 kcal/mol. Remarkably, the pharmacokinetics, biological activities, molecular dynamics, and physicochemical properties of compound 18 (C
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