清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整的填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Genome-wide Epigenetic Study of Chronic Rhinosinusitis Tissues Reveals Dysregulated Inflammatory, Immunologic and Remodeling Pathways

表观遗传学 DNA甲基化 差异甲基化区 表观遗传学 甲基化 医学 组蛋白 生物 亚硫酸氢盐测序 癌症研究 免疫学 遗传学 基因 基因表达
作者
Tripti Brar,Saurabh Baheti,Michael J. Marino,Hirohito Kita,Devyani Lal
出处
期刊:American Journal of Rhinology & Allergy [SAGE]
卷期号:37 (6): 692-704 被引量:2
标识
DOI:10.1177/19458924231193526
摘要

Epigenetics studies mechanisms such as DNA methylation, histone modifications, non-coding RNAs, and alternative polyadenylation that can modify gene activity without changing the underlying DNA nucleotide base-pair structure. Because these changes are reversible, they have potential in developing novel therapeutics. Currently, seven pharmaceutical agents targeting epigenetic changes are FDA approved and commercially available for treatment of certain cancers. However, studies investigating epigenetics in chronic rhinosinusitis (CRS) have not been undertaken previously in the United States.The goal of this study was to investigate sinonasal DNA methylation patterns in CRS versus controls, to discern environmentally-induced epigenetic changes impacting CRS subjects.Ethmoidal samples from CRS and inferior turbinate mucosal tissue samples from controls without CRS were studied. DNA methylation was studied by Reduced Representation Bisulfite Sequencing. RADMeth® biostatistical package was used to identify differentially methylated regions (DMRs) between CRS and controls. Ingenuity Pathway analysis of DMRs was performed to identify top upstream regulators and canonical pathways. Ninety-three samples from 64 CRS subjects (36 CRSwNP; 28 CRSsNP) and 29 controls were studied. CRS and control samples differed in 13 662 CpGs sites and 1381 DMRs. Top upstream regulators identified included: 1. CRS versus controls: TGFB1, TNF, TP53, DGCR8, and beta-estradiol. 2. CRSwNP versus controls: TGFB1, CTNNB1, lipopolysaccharide, ID2, and TCF7L2. 3. CRSsNP versus controls: MYOD1, acetone, ID2, ST8SIA4, and LEPR.Differential patterns of methylation were identified between controls and CRS, CRSwNP, and CRSsNP. Epigenetic, environmentally-induced changes related to novel, inflammatory, immunologic, and remodeling pathways appear to affect epithelial integrity, cell proliferation, homeostasis, vascular permeability, and other yet uncharacterized pathways and genes.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
赧赧完成签到 ,获得积分10
6秒前
wx1完成签到 ,获得积分0
31秒前
ee_Liu完成签到,获得积分10
31秒前
葫芦芦芦完成签到 ,获得积分10
40秒前
俊逸的白梦完成签到 ,获得积分10
42秒前
任性星星完成签到 ,获得积分10
55秒前
珂珂完成签到 ,获得积分10
1分钟前
SI完成签到 ,获得积分10
1分钟前
didi完成签到 ,获得积分10
1分钟前
study00122完成签到,获得积分10
1分钟前
科研狗完成签到 ,获得积分10
1分钟前
kkscanl完成签到 ,获得积分10
1分钟前
bkagyin应助SI采纳,获得10
1分钟前
细心的如天完成签到 ,获得积分10
1分钟前
gmc完成签到 ,获得积分10
1分钟前
爆米花应助SI采纳,获得10
1分钟前
闪闪的谷梦完成签到 ,获得积分10
2分钟前
zz完成签到 ,获得积分10
2分钟前
leezhen完成签到,获得积分10
2分钟前
2分钟前
寒战完成签到 ,获得积分10
2分钟前
2分钟前
oracl完成签到 ,获得积分10
2分钟前
个性仙人掌完成签到 ,获得积分10
2分钟前
香樟遗完成签到 ,获得积分10
3分钟前
一个小胖子完成签到,获得积分10
3分钟前
3分钟前
婉莹完成签到 ,获得积分0
3分钟前
丰富的绮山完成签到,获得积分10
3分钟前
bookgg完成签到 ,获得积分10
4分钟前
睡觉王完成签到 ,获得积分10
4分钟前
深情的凝云完成签到 ,获得积分10
4分钟前
玉鱼儿完成签到 ,获得积分10
4分钟前
123完成签到 ,获得积分10
4分钟前
雪花完成签到 ,获得积分10
5分钟前
北笙完成签到 ,获得积分10
5分钟前
优美的冰巧完成签到 ,获得积分10
5分钟前
双眼皮跳蚤完成签到,获得积分10
5分钟前
5分钟前
Danny完成签到 ,获得积分10
5分钟前
高分求助中
Lire en communiste 1000
Ore genesis in the Zambian Copperbelt with particular reference to the northern sector of the Chambishi basin 800
Becoming: An Introduction to Jung's Concept of Individuation 600
Communist propaganda: a fact book, 1957-1958 500
Briefe aus Shanghai 1946‒1952 (Dokumente eines Kulturschocks) 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3167202
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2818687
关于积分的说明 7921910
捐赠科研通 2478475
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1320348
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 632767
版权声明 602442