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Light inducible protein degradation inE. coliwith the LOVdeg tag

光遗传学 Lac抑制因子 德隆 合成生物学 抑制因子 模块化(生物学) 代谢工程 蛋白质工程 大肠杆菌 模块化设计 计算生物学 化学 生物 计算机科学 生物化学 遗传学 基因 转录因子 神经科学 泛素 泛素连接酶 操作系统
作者
Nathan Tague,Cristian Coriano-Ortiz,Michael B. Sheets,Mary J. Dunlop
标识
DOI:10.1101/2023.02.25.530042
摘要

Abstract Molecular tools for optogenetic control allow for spatial and temporal regulation of cell behavior. In particular, light controlled protein degradation is a valuable mechanism of regulation because it can be highly modular, used in tandem with other control mechanisms, and maintain functionality throughout growth phases. Here, we engineered LOVdeg, a tag that can be appended to a protein of interest for inducible degradation in Escherichia coli using blue light. We demonstrate the modularity of LOVdeg by using it to tag a range of proteins, including the LacI repressor, CRISPRa activator, and the AcrB efflux pump. Additionally, we demonstrate the utility of pairing the LOVdeg tag with existing optogenetic tools to enhance performance by developing a combined EL222 and LOVdeg system. Finally, we use the LOVdeg tag in a metabolic engineering application to demonstrate post-translational control of metabolism. Together, our results highlight the modularity and functionality of the LOVdeg tag system, and introduce a powerful new tool for bacterial optogenetics.

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