Epidermolysis bullosa. II. Type VII collagen mutations and phenotype-genotype correlations in the dystrophic subtypes

异源双工 大疱性表皮松解症 遗传学 生物 突变 聚合酶链反应 基因型 表型 等位基因 分子生物学 基因 外显子
作者
Roslyn Varki,Sara Sadowski,Jouni Uitto,Ellen G Pfendner
出处
期刊:Journal of Medical Genetics [BMJ]
卷期号:44 (3): 181-192 被引量:245
标识
DOI:10.1136/jmg.2006.045302
摘要

Background: The dystrophic forms of epidermolysis bullosa (DEB), a group of heritable blistering disorders, show considerable phenotypic variability, and both autosomal dominant and autosomal recessive inheritance can be recognised. DEB is derived from mutations in the type VII collagen gene (COL7A1), encoding a large collagenous protein that is the predominant, if not exclusive, component of the anchoring fibrils at the dermal–epidermal junction. Methods: The Dystrophic Epidermolysis Bullosa Research Association Molecular Diagnostics Laboratory (Philadelphia, Pennsylvania, USA), established in 1996, has analysed more than 1000 families with different forms of epidermolysis bullosa, among them 332 families with DEB. DNA specimens were subjected to mutation analysis by polymerase chain reaction (PCR) amplification of all 118 exons and flanking intronic sequences of COL7A1, followed either by heteroduplex scanning and sequencing of the PCR products demonstrating heteroduplexes or by direct nucleotide sequencing. Results: 355 mutant alleles out of the anticipated 438 (81.1%) were disclosed. Among these mutations, a total of 242 mutations were distinct and 138 were novel, previously unreported mutations. No evidence of mutations in any other gene was obtained. Discussion: Examination of the mutation database suggested phenotype–genotype correlations, contributing to the improved subclassification of DEB with prognostic implications. The mutation information also forms the basis for accurate genetic counselling and prenatal diagnosis in families at risk for recurrence.
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