Plant genome sequences: past, present, future

生物 基因组 瓶颈 DNA测序 进化生物学 王国 全基因组测序 生态学 生物技术 计算生物学 遗传学 基因 植物 计算机科学 嵌入式系统
作者
Paul Kersey
出处
期刊:Current Opinion in Plant Biology [Elsevier]
卷期号:48: 1-8 被引量:141
标识
DOI:10.1016/j.pbi.2018.11.001
摘要

The green plants (Viridiplantae) are an essential kingdom of life, responsible via photosynthesis for the majority of global primary production, and directly utilized by humankind for nutrition, animal feed, fuel, clothing, medicine and other purposes. There are an estimated 391 000 species of land plants, in addition to 8000 species of green algae. Their genomes are unusually diverse compared to those of other kingdoms, ranging in size from ∼10 Mb to over 100 Gb. Knowledge of plant genomes initially lagged behind those of other kingdoms but has greatly increased with the development of new technologies for DNA sequencing; bioinformatic analysis, rather than data production, is increasingly the bottleneck to further knowledge. Recent proposals are now contemplating the sequencing, assembly and annotation of the genomes of all of the world's plant species; meanwhile, low coverage sequencing to measure diversity across collections and wild populations has already become commonplace for many species, especially those utilized as crops.
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