Systems analysis identifies melanoma-enriched pro-oncogenic networks controlled by the RNA binding protein CELF1

黑色素瘤 生物 RNA结合蛋白 转录组 免疫沉淀 效应器 癌基因 癌症 癌症研究 基因 信使核糖核酸 核糖核酸 计算生物学 基因表达 遗传学 细胞生物学 细胞周期
作者
Metehan Cifdaloz,Lisa Osterloh,Osvaldo Graña‐Castro,Erica Riveiro‐Falkenbach,Pilar Ximénez‐Embún,Javier Muñoz,Cristina Tejedo,Tonantzin G. Calvo,Panagiotis Karras,David Olmeda,Belén Miñana,Marta Cañamero,Estela Cañón,Eduardo Eyras,Haihong Guo,Ferdinand Kappes,Pablo L. Ortiz‐Romero,José Luis Rodríguez‐­Peralto,Diego Megı́as,Juan Valcárcel,Marı́a S. Soengas
出处
期刊:Nature Communications [Springer Nature]
卷期号:8 (1) 被引量:21
标识
DOI:10.1038/s41467-017-02353-y
摘要

Melanomas are well-known for their altered mRNA expression profiles. Yet, the specific contribution of mRNA binding proteins (mRBPs) to melanoma development remains unclear. Here we identify a cluster of melanoma-enriched genes under the control of CUGBP Elav-like family member 1 (CELF1). CELF1 was discovered with a distinct prognostic value in melanoma after mining the genomic landscape of the 692 known mRBPs across different cancer types. Genome-wide transcriptomic, proteomic, and RNA-immunoprecipitation studies, together with loss-of-function analyses in cell lines, and histopathological evaluation in clinical biopsies, revealed an intricate repertoire of CELF1-RNA interactors with minimal overlap with other malignancies. This systems approach uncovered the oncogene DEK as an unexpected target and downstream effector of CELF1. Importantly, CELF1 and DEK were found to represent early-induced melanoma genes and adverse indicators of overall patient survival. These results underscore novel roles of CELF1 in melanoma, illustrating tumor type-restricted functions of RBPs in cancer.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
ori完成签到 ,获得积分10
1秒前
格子完成签到,获得积分10
1秒前
heyvan完成签到 ,获得积分10
2秒前
zhchong5完成签到,获得积分10
2秒前
qiangxu完成签到,获得积分10
2秒前
acadedog完成签到 ,获得积分10
4秒前
李健应助光纤陀螺采纳,获得10
5秒前
一塔湖图完成签到,获得积分10
5秒前
冰留完成签到 ,获得积分10
7秒前
坚强的缘分完成签到,获得积分10
7秒前
Lucas应助科研小木虫采纳,获得10
8秒前
8秒前
xyh完成签到,获得积分10
8秒前
liupeng0403117完成签到,获得积分10
8秒前
简简单单完成签到,获得积分10
8秒前
Annnn完成签到,获得积分10
8秒前
阿城完成签到 ,获得积分10
8秒前
lucky完成签到 ,获得积分10
8秒前
阿米不吃菠菜完成签到 ,获得积分10
10秒前
飞快的珩完成签到,获得积分10
10秒前
咩咩遇到好事了吗完成签到,获得积分10
11秒前
gzgljh完成签到,获得积分10
11秒前
昏睡的白桃完成签到,获得积分10
11秒前
11秒前
此身越重洋完成签到,获得积分10
13秒前
15秒前
罗百事完成签到 ,获得积分10
15秒前
Star1983发布了新的文献求助10
16秒前
jackie完成签到,获得积分10
17秒前
贪玩亿先完成签到 ,获得积分10
19秒前
chun完成签到 ,获得积分10
20秒前
yy完成签到,获得积分10
20秒前
1313131完成签到,获得积分10
20秒前
Misaki完成签到,获得积分10
24秒前
皮蛋努力科研完成签到 ,获得积分10
24秒前
zong240221完成签到 ,获得积分10
25秒前
马东完成签到,获得积分10
25秒前
cyz完成签到,获得积分20
26秒前
30秒前
畅快芝麻完成签到,获得积分10
30秒前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2000
Microlepidoptera Palaearctica, Volumes 1 and 3 - 13 (12-Volume Set) [German] 1122
Дружба 友好报 (1957-1958) 1000
The Data Economy: Tools and Applications 1000
Mantiden - Faszinierende Lauerjäger – Buch gebraucht kaufen 700
PraxisRatgeber Mantiden., faszinierende Lauerjäger. – Buch gebraucht kaufe 700
A Dissection Guide & Atlas to the Rabbit 600
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3099850
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2751315
关于积分的说明 7612736
捐赠科研通 2403282
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1275200
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 616310
版权声明 599053