Antibody production relies on the tRNA inosine wobble modification to meet biased codon demand

转移RNA 密码子使用偏好性 摆动碱基对 抗体 肌苷 生物 基因 翻译(生物学) 蛋白质生物合成 计算生物学 遗传学 核糖核酸 基因组 信使核糖核酸 生物化学
作者
Sophie Giguère,Xuesong Wang,Sabrina M. Huber,L. Xu,John E. Warner,Stephanie R. Weldon,Jennifer Hu,Quynh Anh Phan,Katie Tumang,Thavaleak Prum,Duanduan Ma,Kathrin H. Kirsch,Usha Nair,Peter C. Dedon,Facundo D. Batista
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:383 (6679): 205-211 被引量:8
标识
DOI:10.1126/science.adi1763
摘要

Antibodies are produced at high rates to provide immunoprotection, which puts pressure on the B cell translational machinery. Here, we identified a pattern of codon usage conserved across antibody genes. One feature thereof is the hyperutilization of codons that lack genome-encoded Watson-Crick transfer RNAs (tRNAs), instead relying on the posttranscriptional tRNA modification inosine (I34), which expands the decoding capacity of specific tRNAs through wobbling. Antibody-secreting cells had increased I34 levels and were more reliant on I34 for protein production than naïve B cells. Furthermore, antibody I34-dependent codon usage may influence B cell passage through regulatory checkpoints. Our work elucidates the interface between the tRNA pool and protein production in the immune system and has implications for the design and selection of antibodies for vaccines and therapeutics.
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