A novel pyroptosis-related LncRNA signature predicts prognosis and indicates tumor immune microenvironment in skin cutaneous melanoma

上睑下垂 免疫系统 肿瘤微环境 黑色素瘤 比例危险模型 医学 基因 癌症研究 肿瘤科 生物 内科学 免疫学 程序性细胞死亡 细胞凋亡 遗传学
作者
Jia'nan Zhong,Zheng Wang,Alphonse Houssou Hounye,Jing Liu,Jianglin Zhang,Min Qi
出处
期刊:Life Sciences [Elsevier]
卷期号:307: 120832-120832 被引量:11
标识
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120832
摘要

To explore the correlation between the pyroptosis-related lncRNAs (PRlncRNAs) and the prognosis of skin cutaneous melanoma (SKCM), and clarify the effects of the PRlncRNAs on the tumor immune infiltration.In this study, we utilized RNA-seq and clinical characteristics data obtained from TCGA and GEO database to perform co-expression analysis and LASSO Cox regression analysis to construct a 12-PRlncRNA prognostic prediction model. We also performed functional analysis, immune infiltration analysis and drug sensitivity analysis, as well as correlation analysis with autophagy/ferroptosis genes, tumor mutational burden, and PD-1/PD-L1 genes.The model based on the 12-PRlncRNA signature could effectively predict the prognosis of SKCM. Low risk group had a higher anti-tumor immune level generally compared with high-risk group. The signature was correlated with the expression of autophagy/ferroptosis-related genes and PD1/PD-L1 genes and tumor mutational burden. Additionally, drug sensitivity analysis indicated potential therapeutic targets.Our study demonstrated the impact of PRlncRNAs on SKCM. The model established based on the 12-PRlncRNA showed significant prognostic value for SKCM and may be instructive in pyroptosis-related targeted therapy in the clinic.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Qiuju完成签到,获得积分10
刚刚
lx发布了新的文献求助10
刚刚
ss完成签到 ,获得积分10
刚刚
刚刚
1秒前
脑洞疼应助33采纳,获得10
1秒前
1秒前
2秒前
泡芙完成签到 ,获得积分0
2秒前
2秒前
SciGPT应助炙热的机器猫采纳,获得10
3秒前
好运发布了新的文献求助10
3秒前
dd123发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
家雁菱完成签到,获得积分10
4秒前
mm发布了新的文献求助10
5秒前
Surfy发布了新的文献求助10
5秒前
6秒前
爱的看到完成签到,获得积分10
6秒前
佘蕊完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
maguodrgon发布了新的文献求助30
6秒前
高乐高发布了新的文献求助10
6秒前
丰富的雪糕完成签到,获得积分10
6秒前
8秒前
8秒前
张lulu完成签到,获得积分10
8秒前
mylian完成签到,获得积分10
9秒前
111完成签到 ,获得积分10
10秒前
10秒前
littlepuppy发布了新的文献求助10
11秒前
lie完成签到,获得积分10
12秒前
12秒前
WMT完成签到 ,获得积分10
12秒前
mylian发布了新的文献求助10
12秒前
13秒前
初晴应助foreest采纳,获得10
15秒前
33发布了新的文献求助10
16秒前
壮观的寒松完成签到,获得积分10
17秒前
luuuuuucky完成签到 ,获得积分10
17秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Handbook of pharmaceutical excipients, Ninth edition 5000
Aerospace Standards Index - 2026 ASIN2026 2000
Digital Twins of Advanced Materials Processing 2000
Social Cognition: Understanding People and Events 1200
Polymorphism and polytypism in crystals 1000
Signals, Systems, and Signal Processing 610
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 纳米技术 有机化学 物理 生物化学 化学工程 计算机科学 复合材料 内科学 催化作用 光电子学 物理化学 电极 冶金 遗传学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6037038
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 7757937
关于积分的说明 16216534
捐赠科研通 5183033
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2773745
邀请新用户注册赠送积分活动 1756998
关于科研通互助平台的介绍 1641353