A novel pyroptosis-related LncRNA signature predicts prognosis and indicates tumor immune microenvironment in skin cutaneous melanoma

上睑下垂 免疫系统 肿瘤微环境 黑色素瘤 比例危险模型 医学 基因 癌症研究 肿瘤科 生物 内科学 免疫学 程序性细胞死亡 细胞凋亡 遗传学
作者
Jia'nan Zhong,Zheng Wang,Alphonse Houssou Hounye,Jing Liu,Jianglin Zhang,Min Qi
出处
期刊:Life Sciences [Elsevier BV]
卷期号:307: 120832-120832 被引量:11
标识
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120832
摘要

To explore the correlation between the pyroptosis-related lncRNAs (PRlncRNAs) and the prognosis of skin cutaneous melanoma (SKCM), and clarify the effects of the PRlncRNAs on the tumor immune infiltration.In this study, we utilized RNA-seq and clinical characteristics data obtained from TCGA and GEO database to perform co-expression analysis and LASSO Cox regression analysis to construct a 12-PRlncRNA prognostic prediction model. We also performed functional analysis, immune infiltration analysis and drug sensitivity analysis, as well as correlation analysis with autophagy/ferroptosis genes, tumor mutational burden, and PD-1/PD-L1 genes.The model based on the 12-PRlncRNA signature could effectively predict the prognosis of SKCM. Low risk group had a higher anti-tumor immune level generally compared with high-risk group. The signature was correlated with the expression of autophagy/ferroptosis-related genes and PD1/PD-L1 genes and tumor mutational burden. Additionally, drug sensitivity analysis indicated potential therapeutic targets.Our study demonstrated the impact of PRlncRNAs on SKCM. The model established based on the 12-PRlncRNA showed significant prognostic value for SKCM and may be instructive in pyroptosis-related targeted therapy in the clinic.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
yingying完成签到,获得积分10
刚刚
充电宝应助Altria采纳,获得10
1秒前
1秒前
May发布了新的文献求助10
2秒前
文静妙海发布了新的文献求助10
3秒前
3秒前
4秒前
情怀应助青禾向暖采纳,获得10
4秒前
耍酷冰颜发布了新的文献求助30
5秒前
Jenny完成签到,获得积分10
5秒前
逍遥完成签到,获得积分10
6秒前
核桃发布了新的文献求助50
6秒前
6秒前
lz关闭了lz文献求助
6秒前
忧郁小刺猬完成签到,获得积分10
6秒前
李小小发布了新的文献求助10
8秒前
9秒前
南风南下发布了新的文献求助10
13秒前
FashionBoy应助mogumogu采纳,获得10
13秒前
丘比特应助十七采纳,获得10
13秒前
lmgegege发布了新的文献求助10
14秒前
14秒前
14秒前
14秒前
早上好章鱼哥完成签到 ,获得积分10
14秒前
Aning完成签到,获得积分10
14秒前
molihuakai应助5433采纳,获得10
16秒前
17秒前
17秒前
漂亮绮彤完成签到,获得积分10
18秒前
19秒前
xtt_123发布了新的文献求助10
19秒前
东北大肘子完成签到,获得积分10
20秒前
平城落叶完成签到,获得积分10
20秒前
20秒前
ZNNNN发布了新的文献求助10
21秒前
21秒前
咩咩咩发布了新的文献求助10
21秒前
cheng完成签到,获得积分10
22秒前
黄瓜橙橙发布了新的文献求助10
22秒前
高分求助中
Ideology and Meaning-Making under the Putin Regime 750
Introduction to Industrial/Organizational Psychology 600
Prompt Engineering for Clinicians: Harnessing AI in Everyday Medical Practice 600
Handbook of Luminescence Dating 500
Safety Pharmacology 500
《KNN基无铅压电陶瓷电学性能优化与物理机理研究》 500
Isomerism In Coordination Compounds 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 计算机科学 化学工程 生物化学 物理 内科学 复合材料 催化作用 光电子学 物理化学 电极 细胞生物学 基因 遗传学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 6935297
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 8622207
关于积分的说明 18287797
捐赠科研通 6362719
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3075248
关于科研通互助平台的介绍 2112700
邀请新用户注册赠送积分活动 2052680