CUT&Tag for Efficient Epigenomic Profiling of Frozen Tissues

仿形(计算机编程) 表观遗传学 计算生物学 计算机科学 化学 生物 生物化学 程序设计语言 DNA甲基化 基因 基因表达
作者
Qi Yin,Yang Li,Yuxin Yin
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 181-189 被引量:1
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-4071-5_12
摘要

Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag) provides high-resolution sequencing libraries for profiling diverse chromatin components. This protocol details the steps to generate CUT&Tag libraries from fresh or frozen tissues. This CUT&Tag workflow has nine main steps: isolation of nuclei from tissues, binding of nuclei to Concanavalin A-coated beads, binding of the primary antibody, binding of the secondary antibody, binding pA-Tn5 adapter complex, tagmentation, DNA extraction, PCR, and post-PCR cleanup and size selection. This protocol enabled us to generate and sequence CUT&Tag libraries across a broad range of fresh and frozen tissue types.
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