Jet-cooled laser spectroscopy and solid-state vibrational circular dichroism of the cyclo-(Tyr-Phe) diketopiperazine dipeptide

化学 二肽 振动圆二色性 圆二色性 光谱学 喷射(流体) 固态 结晶学 核磁共振 立体化学 物理化学 生物化学 物理 量子力学 热力学
作者
Jennifer J. DuPont,Régis Guillot,Valéria Lepère,Anne Zehnacker-Rentien
出处
期刊:Journal of Molecular Structure [Elsevier]
卷期号:1262: 133059-133059 被引量:3
标识
DOI:10.1016/j.molstruc.2022.133059
摘要

• The gas-phase structure of a cyclic dipeptide is determined by laser spectroscopy. • Cyclo Tyr-Phe-exists in two geometries, with one ring folded and the other extended. • Minor structural differences happen depending on the chirality of the residues. • The solid-state structure is studied by vibrational circular dichroism. • Dimers involving a double hydrogen bond account for the solid-state results. The structures of the diastereomer diketopiperazine dipeptides cyclo(LTyr-LPhe) and cyclo-(DTyr-LPhe) are studied in the gas phase using resonance-enhanced two-photon ionization, IR/UV double resonance spectroscopy and quantum chemical calculation. Both diastereomers exhibit two conformations, with the tyrosine ring folded over the DKP ring and the phenylalanine ring extended outwards, or vice versa . The two diastereomers differ only slightly by the nature of weak CH···π and NH···π interactions. The crystal structure of cyclo(LTyr-LPhe) is determined by X-ray crystallography and is composed of monomers with folded tyrosine ring. The vibrational circular dichroism spectrum is interpreted by the existence of dimers in the solid state. Quantum chemical calculation shed light on the structural modifications between the gas phase and the solid state.
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