某个蛋白在不同物种间的保守性

综合讨论 3475 8

未知来自云南，发表于：2023-10-16 09:52:57

有没有家人大佬知到不同物种间蛋白保守性在哪里查，怎么查呀，感谢分享

本帖完毕

回帖

8楼

未知 (楼主) 2023-11-17 15:38:53 发布自云南，

zarathustra：在NCBI的nucleotide里下载

赞踩回复

zarathustra：关键字不同结果也不同，如果没有其他物种也可能是因为其他物种数据本身就比较少。另外，现在AIGC非常好用，ChatGPT要花钱，国内有科大讯飞的讯飞星火用着还不错，prompt提的好的话人工智能会给出不错的学习方向和建议。

赞踩回复

嗯嗯感谢感谢

 回复
7楼

zarathustra 2023-11-13 14:25:09 发布自上海，

zarathustra：在NCBI的nucleotide里下载

赞踩回复

关键字不同结果也不同，如果没有其他物种也可能是因为其他物种数据本身就比较少。另外，现在AIGC非常好用，ChatGPT要花钱，国内有科大讯飞的讯飞星火用着还不错，prompt提的好的话人工智能会给出不错的学习方向和建议。

回复
6楼

未知 (楼主) 2023-10-30 09:18:02 发布自云南，

白笑石： BLAST蛋白的同源序列，比对，构建进化树，比较保守性; 或者，uniprot上有蛋白family&domains

赞踩回复

未知：大佬能否细说，有点迷，现在这个网站不是太了解，好多都不清楚，万分感谢

赞踩回复

白笑石： Uniprot是蛋白专用的序列库，包含所选择蛋白的所有信息。你可以先通过NCBI或者本蛋白的转录信息找到唯一的UNIPROT ID, 或者也可以通过uniprot网站内的blast功能找到。然后进入该蛋白的界面，下方左侧找到family；domain这个链接，跳转到该蛋白所有的功能位点及相近蛋白。

赞踩回复

谢谢大佬

 回复
5楼

白笑石 1 2023-10-24 11:27:32 发布自河北，

白笑石： BLAST蛋白的同源序列，比对，构建进化树，比较保守性; 或者，uniprot上有蛋白family&domains

赞踩回复

未知：大佬能否细说，有点迷，现在这个网站不是太了解，好多都不清楚，万分感谢

赞踩回复

Uniprot是蛋白专用的序列库，包含所选择蛋白的所有信息。你可以先通过NCBI或者本蛋白的转录信息找到唯一的UNIPROT ID, 或者也可以通过uniprot网站内的blast功能找到。然后进入该蛋白的界面，下方左侧找到family；domain这个链接，跳转到该蛋白所有的功能位点及相近蛋白。

回复
4楼

未知 (楼主) 2023-10-22 12:31:47 发布自中国，

zarathustra：在NCBI的nucleotide里下载

赞踩回复

万分感谢，我搜索进去之后，最上面只有人的那个蛋白，没有其他物种的呀

 回复
板凳

未知 (楼主) 2023-10-22 12:28:33 发布自中国，

白笑石： BLAST蛋白的同源序列，比对，构建进化树，比较保守性; 或者，uniprot上有蛋白family&domains

赞踩回复

大佬能否细说，有点迷，现在这个网站不是太了解，好多都不清楚，万分感谢

 回复
椅子

白笑石 1 2023-10-20 16:51:21 发布自河北，

BLAST蛋白的同源序列，比对，构建进化树，比较保守性; 或者，uniprot上有蛋白family&domains

回复
沙发

zarathustra 2023-10-17 14:11:50 发布自上海，

在NCBI的nucleotide里下载

 回复

某个蛋白在不同物种间的保守性

今日热心研友