Complete genome sequence data of Pseudomonas nitroreducens L4, an endophyte isolated from cotton plants

生物 全基因组测序 基因组 基因 遗传学 内生菌 GC含量 基因组大小 植物
作者
Hai‐Yang Liu,Lubo Zhuang,Qingchao Zeng
出处
期刊:Data in Brief [Elsevier]
卷期号:55: 110639-110639
标识
DOI:10.1016/j.dib.2024.110639
摘要

Pseudomonas nitroreducens L4 was isolated from the interior of cotton plants, which showed strong biocontrol activity against Verticillium dahlia and other fungal pathogens. To elucidate the biocontrol mechanism, the genome sequence of L4 was sequenced using the Illumina and Nanopore sequencing platform. The assembled genome of L4 consisted of a single circular chromosome was 6,229,472 bp, with an average GC content of 64.95 %, 5,629 protein-coding genes, 72 tRNA, 16 rRNA and 1 tm RNA. Six secondary metabolite biosynthetic gene clusters are identified in the genome. The genome sequence provided a theoretical basis for analyzing the biocontrol mechanism of this strain.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
搜集达人应助cherry采纳,获得10
1秒前
迷路成危完成签到,获得积分10
3秒前
Orange应助奋斗蚂蚁采纳,获得10
3秒前
都是发布了新的文献求助20
3秒前
4秒前
4秒前
ab完成签到,获得积分10
5秒前
zhangjing发布了新的文献求助10
5秒前
今天吃什么呢关注了科研通微信公众号
5秒前
6秒前
Docline完成签到,获得积分10
6秒前
北beibe完成签到,获得积分10
7秒前
神外第一刀完成签到 ,获得积分10
8秒前
seedcode完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
得得得123发布了新的文献求助10
9秒前
10秒前
一粒猫子完成签到,获得积分10
10秒前
tuanheqi应助Hehhhh采纳,获得50
10秒前
check003完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
Arroble完成签到 ,获得积分10
13秒前
13秒前
14秒前
14秒前
Ronnie发布了新的文献求助30
15秒前
Aurora发布了新的文献求助10
15秒前
搜集达人应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
小蘑菇应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
MayLuoA应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
bkagyin应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
Hello应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
17秒前
17秒前
桐桐应助科研通管家采纳,获得10
17秒前
奋斗蚂蚁发布了新的文献求助10
17秒前
18秒前
19秒前
bjbmtxy发布了新的文献求助20
20秒前
21秒前
高分求助中
Востребованный временем 2500
Classics in Total Synthesis IV: New Targets, Strategies, Methods 1000
Mantids of the euro-mediterranean area 600
The Oxford Handbook of Educational Psychology 600
Injection and Compression Molding Fundamentals 500
Mantodea of the World: Species Catalog Andrew M 500
Insecta 2. Blattodea, Mantodea, Isoptera, Grylloblattodea, Phasmatodea, Dermaptera and Embioptera 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 内科学 物理 纳米技术 计算机科学 基因 遗传学 化学工程 复合材料 免疫学 物理化学 细胞生物学 催化作用 病理
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3421671
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3022321
关于积分的说明 8900216
捐赠科研通 2709561
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1485986
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 686926
邀请新用户注册赠送积分活动 682056