Integrating human brain proteomes with genome-wide association data implicates novel proteins in post-traumatic stress disorder

全基因组关联研究 转录组 蛋白质组 基因组学 生物 遗传关联 神经科学 基因 遗传学 医学 基因组 单核苷酸多态性 基因表达 基因型
作者
Thomas S. Wingo,Ekaterina S. Gerasimov,Yue Liu,Duc M. Duong,Selina Vattathil,Adriana Lori,Jake Gockley,Michael S. Breen,Adam X. Maihofer,Caroline M. Nievergelt,Karestan C. Koenen,Daniel F. Levey,Joel Gelernter,Murray B. Stein,Kerry J. Ressler,David A. Bennett,Allan I. Levey,Nicholas T. Seyfried,Aliza P. Wingo
出处
期刊:Molecular Psychiatry [Springer Nature]
卷期号:27 (7): 3075-3084 被引量:29
标识
DOI:10.1038/s41380-022-01544-4
摘要

Genome-wide association studies (GWAS) have identified several risk loci for post-traumatic stress disorder (PTSD); however, how they confer PTSD risk remains unclear. We aimed to identify genes that confer PTSD risk through their effects on brain protein abundance to provide new insights into PTSD pathogenesis. To that end, we integrated human brain proteomes with PTSD GWAS results to perform a proteome-wide association study (PWAS) of PTSD, followed by Mendelian randomization, using a discovery and confirmatory study design. Brain proteomes (N = 525) were profiled from the dorsolateral prefrontal cortex using mass spectrometry. The Million Veteran Program (MVP) PTSD GWAS (n = 186,689) was used for the discovery PWAS, and the Psychiatric Genomics Consortium PTSD GWAS (n = 174,659) was used for the confirmatory PWAS. To understand whether genes identified at the protein-level were also evident at the transcript-level, we performed a transcriptome-wide association study (TWAS) using human brain transcriptomes (N = 888) and the MVP PTSD GWAS results. We identified 11 genes that contribute to PTSD pathogenesis via their respective cis-regulated brain protein abundance. Seven of 11 genes (64%) replicated in the confirmatory PWAS and 4 of 11 also had their cis-regulated brain mRNA levels associated with PTSD. High confidence level was assigned to 9 of 11 genes after considering evidence from the confirmatory PWAS and TWAS. Most of the identified genes are expressed in other PTSD-relevant brain regions and several are preferentially expressed in excitatory neurons, astrocytes, and oligodendrocyte precursor cells. These genes are novel, promising targets for mechanistic and therapeutic studies to find new treatments for PTSD.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
小丸子和zz完成签到 ,获得积分10
1秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
2秒前
江雁完成签到,获得积分10
2秒前
坚定芯完成签到,获得积分10
2秒前
叶子兮完成签到,获得积分10
4秒前
幽默的妍完成签到 ,获得积分10
4秒前
Snow完成签到 ,获得积分10
4秒前
4秒前
liuyuh完成签到,获得积分10
5秒前
悠明夜月完成签到 ,获得积分10
6秒前
乌云乌云快走开完成签到,获得积分10
6秒前
你是我的唯一完成签到 ,获得积分10
6秒前
洁白的故人完成签到 ,获得积分10
8秒前
乐观半兰发布了新的文献求助10
8秒前
water应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
zhang完成签到 ,获得积分10
9秒前
water应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
Jasper应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
orixero应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
CodeCraft应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
大模型应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
9秒前
鲲鹏完成签到 ,获得积分10
10秒前
大气建辉完成签到 ,获得积分10
10秒前
尛森完成签到,获得积分10
10秒前
机灵枕头完成签到 ,获得积分10
11秒前
糖糖科研顺利呀完成签到 ,获得积分10
13秒前
辣小扬完成签到 ,获得积分10
15秒前
传奇3应助水晶茶杯采纳,获得10
17秒前
幽默的素阴完成签到 ,获得积分10
21秒前
小小鱼完成签到 ,获得积分10
28秒前
28秒前
甜美砖家完成签到 ,获得积分10
30秒前
superspace完成签到,获得积分10
31秒前
nn发布了新的文献求助10
33秒前
求助完成签到,获得积分10
34秒前
35秒前
翁雁丝完成签到 ,获得积分10
42秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038112
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575788
关于积分的说明 11373801
捐赠科研通 3305604
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819255
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022