Highly Sensitive Detection of Protein with Aptamer-Based Target-Triggering Two-Stage Amplification

适体 化学 检出限 环介导等温扩增 蛋白质检测 荧光 生物分子 DNA 生物物理学 色谱法 生物系统 纳米技术 分子生物学 生物化学 物理 生物 材料科学 量子力学
作者
Zhen-zhu Zhang,Chun‐yang Zhang
出处
期刊:Analytical Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:84 (3): 1623-1629 被引量:139
标识
DOI:10.1021/ac2029002
摘要

Highly sensitive detection of proteins is essential to biomedical research as well as clinical diagnosis. However, so far most detection methods rely on antibody-based assays and are usually laborious and time-consuming with poor sensitivity. Here, we develop a simple and sensitive method for the detection of a biomarker protein, platelet-derived growth factor BB (PDGF-BB), based on aptamer-based target-triggering two-stage amplification. With the involvement of an aptamer-based probe and an exponential amplification reaction (EXPAR) template, our method combines strand displacement amplification (SDA) and EXPAR, transforming the probe conformational change induced by target binding into two-stage amplification and distinct fluorescence signal. This detection method exhibits excellent specificity and high sensitivity with a detection limit of 9.04 × 10–13 M and a detection range of more than 5 orders of magnitude, which is comparable with or even superior to most currently used approaches for PDGF-BB detection. Moreover, this detection method has significant advantages of isothermal conditions required, simple and rapid without multiple separation and washing steps, low-cost without the need of any labeled DNA probes. Furthermore, this method might be extended to sensitive detection of a variety of biomolecules whose aptamers undergo similar conformational changes.
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