Multiomics and artificial intelligence enabled peripheral blood-based prediction of amnestic mild cognitive impairment

痴呆 生物标志物 医学 代谢组 外周血 队列 生物标志物发现 组学 认知障碍 生物信息学 认知 内科学 肿瘤科 蛋白质组学 生物 精神科 疾病 代谢物 生物化学 基因
作者
Yota Tatara,Hiromi Yamazaki,Fumiki Katsuoka,Mitsuru Chiba,Daisuke Saigusa,Shuya Kasai,Tomohiro Nakamura,Jin Inoue,Yuichi Aoki,Miho Shoji,Ikuko N. Motoike,Yoshinori Tamada,Katsuhito Hashizume,Mikio Shoji,Kengo Kinoshita,Koichi Murashita,Shigeyuki Nakaji,Masayuki Yamamoto,Ken Itoh
出处
期刊:Current Research in Translational Medicine [Elsevier]
卷期号:71 (1): 103367-103367 被引量:7
标识
DOI:10.1016/j.retram.2022.103367
摘要

Since dementia is preventable with early interventions, biomarkers that assist in diagnosing early stages of dementia, such as mild cognitive impairment (MCI), are urgently needed.Multiomics analysis of amnestic MCI (aMCI) peripheral blood (n = 25) was performed covering the transcriptome, microRNA, proteome, and metabolome. Validation analysis for microRNAs was conducted in an independent cohort (n = 12). Artificial intelligence was used to identify the most important features for predicting aMCI.We found that hsa-miR-4455 is the best biomarker in all omics analyses. The diagnostic index taking a ratio of hsa-miR-4455 to hsa-let-7b-3p predicted aMCI patients against healthy subjects with 97% overall accuracy. An integrated review of multiomics data suggested that a subset of T cells and the GCN (general control nonderepressible) pathway are associated with aMCI.The multiomics approach has enabled aMCI biomarkers with high specificity and illuminated the accompanying changes in peripheral blood. Future large-scale studies are necessary to validate candidate biomarkers for clinical use.
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