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ALTERED MERISTEM PROGRAM1 impairs RNA silencing by repressing the biogenesis of a subset of inverted repeat–derived siRNAs

生物 阿尔戈瑙特 反式siRNA 掷骰子 小干扰RNA RNA诱导的转录沉默 基因沉默 细胞生物学 RNA沉默 RNA诱导沉默复合物 核糖核酸 抄写(语言学) 分子生物学 RNA干扰 遗传学 基因 哲学 语言学
作者
Jing Li,Brandon H. Le,Xufeng Wang,Ye Xu,Suikang Wang,Hao Li,Lei Gao,Beixin Mo,Lin Liu,Xuemei Chen
出处
期刊:The Plant Cell [Oxford University Press]
标识
DOI:10.1093/plcell/koae293
摘要

Abstract RNA silencing negatively regulates gene expression at the transcriptional and post-transcriptional levels through DNA methylation, histone modification, mRNA cleavage, and translational inhibition. Small interfering RNAs (siRNAs) of 21 to 24 nucleotides are processed from double-stranded RNAs by Dicer-like enzymes and play essential roles in RNA silencing in plants. Here, we demonstrated that ALTERED MERISTEM PROGRAM1 (AMP1) and its putative paralog LIKE AMP1 (LAMP1) impair RNA silencing by repressing the biogenesis of a subset of inverted repeat (IR)–derived siRNAs in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). AMP1 and LAMP1 inhibit Pol II-dependent IR gene transcription by suppressing ARGONAUTE 1 (AGO1) protein levels. Genetic analysis indicates that AMP1 acts upstream of RNA polymerase IV subunit 1 (NRPD1), RNA-dependent RNA polymerase 2 (RDR2), and Dicer-Like 4 (DCL4), which are required for IR-induced RNA silencing. We also show that AMP1 and LAMP1 inhibit siRNA-mediated silencing in a different mechanism from AGO4 and DCL3. Together, these results reveal two previously unknown players in siRNA biogenesis from IRs – AGO1, which promotes IR transcription, and AMP1, which inhibits IR transcription indirectly through the repression of AGO1 expression.
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