Detection of RGNNV genotype betanodavirus in the Black Sea and monitoring studies

生物 病毒 病毒学 基因型 聚合酶链反应 水产养殖 水生动物 黑鲈 渔业 基因 遗传学
作者
Murat Kaplan,Kadir Pekmez,Buket Ozkan,Abdurrahman Anil Cagirgan,Gülşah Kalaycı
出处
期刊:Diseases of Aquatic Organisms [Inter-Research Science Center]
卷期号:144: 117-121 被引量:6
标识
DOI:10.3354/dao03583
摘要

Viral nervous necrosis (VNN), caused by betanodavirus, is a significant viral infection that threatens marine aquaculture. Freshwater and marine fish farms in Turkey are subjected to annual pathogen screenings. In 2016, during the Nervous Necrosis Virus screening program conducted in the Black Sea, betanodavirus was unexpectedly detected using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction in apparently healthy sea bass. Phylogenetic analysis of both the RNA1 and RNA2 segments of the virus determined that the betanodavirus detected was red-spotted grouper nervous necrosis virus genotype (RGNNV). Following the initial discovery of betanodavirus in the Black Sea, monitoring studies performed over a 3 yr period have not indicated any additional presence of the virus. The absence of clinical symptoms related to VNN disease in the area’s marine fish farms and the surrounding detection zone, and the fact that the virus has not been detected anew in monitoring programmes conducted following the initial detection, indicate that there is no virus circulation in the detection zone.

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