Probabilistic model of the human protein-protein interaction network

相互作用体 计算生物学 交互网络 蛋白质-蛋白质相互作用 计算机科学 基因组学 概率逻辑 模式生物 蛋白质结构域 生物 基因组 基因 遗传学 人工智能
作者
Daniel R. Rhodes,Scott A. Tomlins,Sooryanarayana Varambally,Vasudeva Mahavisno,Terrence R. Barrette,Shanker Kalyana‐Sundaram,Ottavio De Cobelli,Akhilesh Pandey,Arul M. Chinnaiyan
出处
期刊:Nature Biotechnology [Nature Portfolio]
卷期号:23 (8): 951-959 被引量:398
标识
DOI:10.1038/nbt1103
摘要

A catalog of all human protein-protein interactions would provide scientists with a framework to study protein deregulation in complex diseases such as cancer. Here we demonstrate that a probabilistic analysis integrating model organism interactome data, protein domain data, genome-wide gene expression data and functional annotation data predicts nearly 40,000 protein-protein interactions in humans-a result comparable to those obtained with experimental and computational approaches in model organisms. We validated the accuracy of the predictive model on an independent test set of known interactions and also experimentally confirmed two predicted interactions relevant to human cancer, implicating uncharacterized proteins into definitive pathways. We also applied the human interactome network to cancer genomics data and identified several interaction subnetworks activated in cancer. This integrative analysis provides a comprehensive framework for exploring the human protein interaction network.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
传奇3应助Xw采纳,获得10
刚刚
1秒前
1秒前
别闹闹发布了新的文献求助10
4秒前
幸运星发布了新的文献求助10
4秒前
CipherSage应助mark采纳,获得10
6秒前
pluto应助从容的香菇采纳,获得10
6秒前
科研通AI5应助cccyq采纳,获得10
7秒前
科研狗完成签到,获得积分10
9秒前
英俊的铭应助gs19960828采纳,获得10
10秒前
MrTStar完成签到 ,获得积分10
12秒前
淡定的惜完成签到,获得积分20
15秒前
完美世界应助fengliurencai采纳,获得10
20秒前
思源应助大面包采纳,获得10
21秒前
sandra完成签到 ,获得积分10
22秒前
iris601完成签到,获得积分10
24秒前
时笙发布了新的文献求助30
26秒前
温柔的迎荷完成签到,获得积分10
28秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
30秒前
31秒前
31秒前
传奇3应助快乐一江采纳,获得10
32秒前
传统的纸飞机完成签到 ,获得积分10
32秒前
32秒前
32秒前
王子安应助lilila666采纳,获得10
34秒前
大面包发布了新的文献求助10
35秒前
情怀应助漫山采纳,获得10
36秒前
zzz完成签到,获得积分10
37秒前
gs19960828发布了新的文献求助10
38秒前
幸福大白发布了新的文献求助30
38秒前
脑洞疼应助jbhb采纳,获得10
42秒前
42秒前
gs19960828完成签到,获得积分10
43秒前
Younglee完成签到,获得积分10
47秒前
47秒前
xiaoxuan完成签到,获得积分10
48秒前
49秒前
Garnieta完成签到,获得积分10
50秒前
彤光赫显发布了新的文献求助10
51秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
‘Unruly’ Children: Historical Fieldnotes and Learning Morality in a Taiwan Village (New Departures in Anthropology) 400
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
基于可调谐半导体激光吸收光谱技术泄漏气体检测系统的研究 350
Robot-supported joining of reinforcement textiles with one-sided sewing heads 320
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3989406
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3531522
关于积分的说明 11254187
捐赠科研通 3270174
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1804901
邀请新用户注册赠送积分活动 882105
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 809174