Next-Generation Sequencing Technologies

DNA测序 大规模并行测序 生物 基因组 全基因组测序 计算生物学 杂交基因组组装 人类基因组 霰弹枪测序 参考基因组 基因组学 遗传学 深度测序 癌症基因组测序 DNA 基因
作者
W. Richard McCombie,John D. McPherson,Elaine R. Mardis
出处
期刊:Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine [Cold Spring Harbor Laboratory]
卷期号:9 (11): a036798-a036798 被引量:204
标识
DOI:10.1101/cshperspect.a036798
摘要

Although DNA and RNA sequencing has a history spanning five decades, large-scale massively parallel sequencing, or next-generation sequencing (NGS), has only been commercially available for about 10 years. Nonetheless, the meteoric increase in sequencing throughput with NGS has dramatically changed our understanding of our genome and ourselves. Sequencing the first human genome as a haploid reference took nearly 10 years but now a full diploid human genome sequence can be accomplished in just a few days. NGS has also reduced the cost of generating sequence data and a plethora of sequence-based methods for probing a genome have emerged using NGS as the readout and have been applied to many species. NGS methods have also entered the medical realm and will see an increasing use in diagnosis and treatment. NGS has largely been driven by short-read generation (150 bp) but new platforms have emerged and are now capable of generating long multikilobase reads. These latter platforms enable reference-independent genome assemblies and long-range haplotype generation. Rapid DNA and RNA sequencing is now mainstream and will continue to have an increasing impact on biology and medicine.
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