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The transcriptional integration of environmental cues with root cell type development

生物 重编程 转录组 拟南芥 拟南芥 非生物成分 功能(生物学) 电池类型 词根(语言学) 神经科学 细胞生物学 生态学 细胞 遗传学 基因 基因表达 语言学 哲学 突变体
作者
Mona Gouran,Siobhán M. Brady
出处
期刊:Plant Physiology [Oxford University Press]
标识
DOI:10.1093/plphys/kiae425
摘要

Abstract Plant roots navigate the soil ecosystem with each cell type uniquely responding to environmental stimuli. Below ground, the plant's response to its surroundings is orchestrated at the cellular level, including morphological and molecular adaptations that shape root system architecture as well as tissue and organ functionality. Our understanding of the transcriptional responses at cell type resolution has been profoundly enhanced by studies of the model plant Arabidopsis thaliana. However, both a comprehensive view of the transcriptional basis of these cellular responses to single and combinatorial environmental cues in diverse plant species remains elusive. In this review, we highlight the ability of root cell types to undergo specific anatomical or morphological changes in response to abiotic and biotic stresses or cues and how they collectively contribute to the plant's overall physiology. We further explore interconnections between stress and the temporal nature of developmental pathways and discuss examples of how this transcriptional reprogramming influences cell type identity and function. Finally, we highlight the power of single-cell and spatial transcriptomic approaches to refine our understanding of how environmental factors fine tune root spatiotemporal development. These complex root system responses underscore the importance of spatiotemporal transcriptional mapping, with significant implications for enhanced agricultural resilience.
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