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Exploring shared therapeutic targets in diabetic cardiomyopathy and diabetic foot ulcers through bioinformatics analysis

生物信息学 基因 医学 小RNA 计算生物学 基因调控网络 糖尿病 疾病 基因表达 生物 内科学 遗传学 内分泌学
作者
Hanlin Wu,Zheming Yang,Jing Wang,Yuxin Bu,Yani Wang,Kai Xu,Jing Li,Chenghui Yan,Dan Liu,Yaling Han
出处
期刊:Scientific Reports [Springer Nature]
卷期号:14 (1) 被引量:1
标识
DOI:10.1038/s41598-023-50954-z
摘要

Abstract Advanced diabetic cardiomyopathy (DCM) patients are often accompanied by severe peripheral artery disease. For patients with DCM combined with diabetic foot ulcer (DFU), there are currently no good therapeutic targets and drugs. Here, we investigated the underlying network of molecular actions associated with the occurrence of these two complications. The datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. We performed enrichment and protein–protein interaction analyses, and screened for hub genes. Construct transcription factors (TFs) and microRNAs regulatory networks for validated hub genes. Finally, drug prediction and molecular docking verification were performed. We identified 299 common differentially expressed genes (DEGs), many of which were involved in inflammation and lipid metabolism. 6 DEGs were identified as hub genes (PPARG, JUN, SLC2A1, CD4, SCARB1 and SERPINE1). These 6 hub genes were associated with inflammation and immune response. We identified 31 common TFs and 2 key miRNAs closely related to hub genes. Interestingly, our study suggested that fenofibrate, a lipid-lowering medication, holds promise as a potential treatment for DCM combined with DFU due to its stable binding to the identified hub genes. Here, we revealed a network involves a common target for DCM and DFU. Understanding these networks and hub genes is pivotal for advancing our comprehension of the multifaceted complications of diabetes and facilitating the development of future therapeutic interventions.
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