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Neural network approach for predicting infrared spectra from 3D molecular structure

红外线的 红外光谱学 人工神经网络 谱线 化学 生物系统 化学物理 模式识别(心理学) 计算机科学 人工智能 物理 生物 光学 有机化学 天文
作者
Saleh Abdul Al,A. Allouche
出处
期刊:Chemical Physics Letters [Elsevier BV]
卷期号:856: 141603-141603
标识
DOI:10.1016/j.cplett.2024.141603
摘要

Accurately predicting infrared (IR) spectra in computational chemistry using ab initio methods remains a challenge.Current approaches often rely on an empirical approach or on tedious anharmonic calculations, mainly adapted to semi-rigid molecules.This limitation motivates us to explore alternative methodologies.Previous studies explored machine-learning techniques for potential and dipolar surface generation, followed by IR spectra calculation using classical molecular dynamics.However, these methods are computationally expensive and require molecule-by-molecule processing.Our article introduces a new approach to improve IR spectra prediction accuracy within a significantly reduced computing time.We developed a machine learning (ML) model to directly predict IR spectra from three-dimensional (3D) molecular structures.The spectra predicted by our model significantly outperform those from density functional theory (DFT) calculations, even after scaling.In a test set of 200 molecules, our model achieves a Spectral Information Similarity Metric (SIS) of 0.92, surpassing the value achieved by DFT scaled frequencies, which is 0.57.Additionally, our model considers anharmonic effects, offering a fast alternative to laborious anharmonic calculations.Moreover, our model can be used to predict various types of spectra (Ultraviolet or Nuclear Magnetic Resonance for example) as a function of molecular structure.All it needs is a database of 3D structures and their associated spectra.
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