Quantum Mechanical (QM) Calculations Applied to ADMET Drug Prediction: A Review

从头算 计算化学 密度泛函理论 生物信息学 化学 药物发现 药品 数量结构-活动关系 立体化学 药理学 生物化学 有机化学 生物 基因
作者
Edeildo Ferreira da Silva‐Júnior,Thiago Mendonça de Aquino,João Xavier de Araújo‐Junior
出处
期刊:Current Drug Metabolism [Bentham Science]
卷期号:18 (6) 被引量:9
标识
DOI:10.2174/1389200218666170316094514
摘要

The discovery of new drugs is generally considered a long and expensive process, which often leads to molecules with low efficacy and high toxicity, which in many cases can be related to metabolism. In an attempt to reduce these failures and the production costs of a new drug, in silico studies have been used to obtain important information about the behavior of these compounds in the metabolism phases: absorption, distribution, metabolism (or biotransformation) and elimination (or excretion). Quantum Mechanical (QM) calculations are based on Schrödinger’s equation that can be used to develop models and theoretical parameters able to explain properties observed experimentally. In recent years, there has been an increase in the development of studies involving the application of QM methods to describe properties related to ADMET profile of new compounds. Amongst these, the most commonly used methods are ab initio (Hartree-Fock), Semiempirical (AM1 and PM3) and Density Functional Theory (DFT). The application of these methods allows the modeling of the predicted profile of absorption and elimination of chalcone-chloroquinoline hybrids; the ability of drugs to cross the blood-brain barrier (distribution); proposal of the route for oxidation of several compounds, via CYP450; and to predict the toxicity of pyrethroid analogs. Finally, QM methods can be considered as a valuable tool in the prediction of metabolism when applied to drug discovery. Keywords: Hartree-Fock, ab initio, DFT, semiempirical, metabolism, ADMET.
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