Unusual guide-binding pockets in RNA-targeting pAgo nucleases

核糖核酸 计算生物学 生物 化学 遗传学 基因
作者
Aleksei Agapov,Lidiya Lisitskaya,Xeniya Kussakina,Ekaterina Kropocheva,Daria Esyunina,Andrey Kulbachinskiy
出处
期刊:Journal of Molecular Biology [Elsevier BV]
卷期号:436 (20): 168745-168745
标识
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168745
摘要

Argonaute nucleases use small nucleic acid guides to recognize and degrade complementary nucleic acid targets. Most prokaryotic Argonautes (pAgos) recognize DNA targets and may play a role in cell immunity against invader genetic elements. We have recently described two related groups of pAgo nucleases that have distinct specificity for DNA guides and RNA targets (DNA > RNA pAgos). Here, we describe additional pAgos from the same clades of the pAgo tree and demonstrate that they have the same unusual nucleic acid specificity. The two groups of DNA > RNA pAgos have non-standard guide-binding pockets in the MID domain and differ in the register of guide DNA binding and target cleavage. In contrast to other pAgos, which coordinate the 5'-end of the guide molecule by their C-terminal carboxyl, DNA > RNA pAgos have an extended C-terminus located away from the MID pocket. We show that modifications of the C-terminus do not affect guide DNA binding, but inhibit cleavage of complementary and mismatched RNA targets by some DNA > RNA pAgos. Our data suggest that the unique C-terminus found in DNA > RNA pAgos can modulate their catalytic properties and can be used as a target for pAgo modifications.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
speed完成签到 ,获得积分10
1秒前
RYK完成签到 ,获得积分10
2秒前
3秒前
cm发布了新的文献求助10
7秒前
9秒前
9秒前
9秒前
9秒前
9秒前
大力水手完成签到,获得积分0
11秒前
13秒前
cm完成签到,获得积分10
15秒前
酷炫的听枫完成签到 ,获得积分10
16秒前
吱吱吱完成签到 ,获得积分10
17秒前
18秒前
上善若水呦完成签到 ,获得积分10
18秒前
小羡完成签到 ,获得积分10
18秒前
cqwswfl完成签到 ,获得积分20
19秒前
南山无梅落完成签到,获得积分10
20秒前
啵妞完成签到 ,获得积分10
20秒前
上官若男应助qiqi采纳,获得30
22秒前
拼搏的潘子完成签到,获得积分10
23秒前
zsj完成签到,获得积分10
24秒前
dolesy发布了新的文献求助10
25秒前
执着烧鹅完成签到 ,获得积分10
25秒前
哈哈哈完成签到,获得积分10
27秒前
yar应助博修采纳,获得10
29秒前
可爱的函函应助博修采纳,获得10
29秒前
MchemG应助博修采纳,获得10
29秒前
酷波er应助博修采纳,获得10
30秒前
时代更迭完成签到 ,获得积分10
30秒前
31秒前
WGOIST完成签到,获得积分10
32秒前
九九完成签到 ,获得积分10
32秒前
李新宇完成签到 ,获得积分10
33秒前
大橙子发布了新的文献求助10
37秒前
库凯伊完成签到,获得积分10
37秒前
duckspy发布了新的文献求助10
38秒前
CodeCraft应助jenny采纳,获得10
40秒前
lhnsisi完成签到,获得积分10
41秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Handbook of Industrial Diamonds.Vol2 1100
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038157
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3575869
关于积分的说明 11373842
捐赠科研通 3305650
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819255
邀请新用户注册赠送积分活动 892655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815022