DNA-Encoded Library Screening Identifies Benzo[b][1,4]oxazepin-4-ones as Highly Potent and Monoselective Receptor Interacting Protein 1 Kinase Inhibitors

化学 激酶 药物发现 小分子 基诺美 结构-活动关系 选择性 受体 生物化学 体外 催化作用
作者
Philip A. Harris,Bryan W. King,Deepak Bandyopadhyay,Scott B. Berger,Nino Campobasso,Carol A. Capriotti,Julie A. Cox,Lauren Dare,Xiaoyang Dong,Joshua N. Finger,LaShadric C. Grady,Sandra J. Hoffman,Jae Uk Jeong,James Kang,Viera Kasparcova,Ami S. Lakdawala,Ruth Lehr,Dean E. McNulty,Rakesh Nagilla,Michael T. Ouellette,Christina S. Pao,Alan R. Rendina,Michelle C. Schaeffer,Jennifer D. Summerfield,Brandon Swift,Rachel D. Totoritis,Paris Ward,Aming Zhang,Dao Hua Zhang,Robert W. Marquis,John Bertin,Peter J. Gough
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:59 (5): 2163-2178 被引量:231
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5b01898
摘要

The recent discovery of the role of receptor interacting protein 1 (RIP1) kinase in tumor necrosis factor (TNF)-mediated inflammation has led to its emergence as a highly promising target for the treatment of multiple inflammatory diseases. We screened RIP1 against GSK's DNA-encoded small-molecule libraries and identified a novel highly potent benzoxazepinone inhibitor series. We demonstrate that this template possesses complete monokinase selectivity for RIP1 plus unique species selectivity for primate versus nonprimate RIP1. We elucidate the conformation of RIP1 bound to this benzoxazepinone inhibitor driving its high kinase selectivity and design specific mutations in murine RIP1 to restore potency to levels similar to primate RIP1. This series differentiates itself from known RIP1 inhibitors in combining high potency and kinase selectivity with good pharmacokinetic profiles in rodents. The favorable developability profile of this benzoxazepinone template, as exemplified by compound 14 (GSK'481), makes it an excellent starting point for further optimization into a RIP1 clinical candidate.
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