FPIA: A database for gene fusion profiling and interactive analyses

癌变 计算生物学 微卫星不稳定性 生物 基因 数据库 生物信息学 基因表达谱 基因表达 融合基因 计算机科学 遗传学 微卫星 等位基因
作者
Lu Huang,Huimin Zhu,Zhenhua Luo,Chukun Luo,Linjiang Luo,Baoting Nong,Shiyu Zhang,Chengcheng Wan,Yanzhi Wang,Zhou Songyang,Yuanyan Xiong
出处
期刊:International Journal of Cancer [Wiley]
卷期号:150 (9): 1504-1511 被引量:6
标识
DOI:10.1002/ijc.33921
摘要

Abstract As one of the hallmarks of cancer, gene fusions play an important role in tumorigenesis, and have been established as biomarkers and therapeutic targets. Although recent years have witnessed the development of gene fusion databases, a tool with interactive analytic functions remains lacking. Here, we introduce fusion profiling interactive analysis (FPIA), a web server to perform interactive and customizable analysis on fusion genes. With this platform, researchers can easily explore fusion‐associated biological and molecular differences including gene expression, tumor purity and ploidy, mutation, copy number variations, protein expression, immune cell infiltration, stemness, telomere length, microsatellite instability, survival and novel peptides based on 33 cancer types from The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. Currently, it contains 31 633 fusion events from 6910 patients. FPIA complements the existing gene fusion annotation databases with its multiomics analytic capacity, integrated analysis features, customized analysis selection and user‐friendly design. The comprehensive data analyses by FPIA will greatly facilitate data mining, hypothesis generation and therapeutic target discovery. FPIA is available at http://bioinfo-sysu.com/fpia .
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Akim应助友好问凝采纳,获得10
1秒前
gloria关注了科研通微信公众号
2秒前
小六发布了新的文献求助20
3秒前
Simone发布了新的文献求助10
3秒前
廖天佑完成签到,获得积分10
4秒前
4秒前
李健的小迷弟应助li采纳,获得10
6秒前
忧心的荧荧完成签到,获得积分10
8秒前
violin发布了新的文献求助10
9秒前
Amy完成签到,获得积分20
10秒前
11秒前
11秒前
11秒前
fufu完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
SCI孵化中心完成签到 ,获得积分10
14秒前
星弟完成签到 ,获得积分10
15秒前
15秒前
美满的冬卉完成签到 ,获得积分10
16秒前
16秒前
KT发布了新的文献求助10
16秒前
17秒前
Timothy完成签到 ,获得积分10
17秒前
Jasper应助violin采纳,获得10
17秒前
uno完成签到,获得积分10
17秒前
一繁发布了新的文献求助10
18秒前
18秒前
新火新茶完成签到 ,获得积分10
19秒前
19秒前
20秒前
WJ发布了新的文献求助10
20秒前
王煊完成签到,获得积分10
20秒前
跳跃的裘发布了新的文献求助10
20秒前
爱科研168完成签到,获得积分10
21秒前
lydy1993完成签到,获得积分10
21秒前
小六完成签到,获得积分10
22秒前
23秒前
王煊发布了新的文献求助10
24秒前
WQY发布了新的文献求助10
24秒前
Whhhhh完成签到,获得积分10
25秒前
高分求助中
Evolution 10000
ISSN 2159-8274 EISSN 2159-8290 1000
Becoming: An Introduction to Jung's Concept of Individuation 600
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 500
The Kinetic Nitration and Basicity of 1,2,4-Triazol-5-ones 440
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3159794
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2810676
关于积分的说明 7889157
捐赠科研通 2469817
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1315087
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 630742
版权声明 602012