Identification of key biomarkers related to epithelial‐mesenchymal transition and immune infiltration in ameloblastoma using integrated bioinformatics analysis

小桶 通路分析 免疫系统 基因 DNA微阵列 生物 下调和上调 计算生物学 生物信息学 癌症研究 基因表达 免疫学 遗传学 转录组
作者
Zhao Zhang,Ye Peng,Jingyi Dang,Xincheng Liu,Dongze Zhu,Yushen Zhang,Yubo Shi,Hongbin Fan
出处
期刊:Oral Diseases [Wiley]
卷期号:29 (4): 1657-1667 被引量:16
标识
DOI:10.1111/odi.14173
摘要

This study aimed to elucidate the underlying mechanisms of ameloblastoma (AM) through integrated bioinformatics analysis.We downloaded two microarrays of AMs from the GEO database and identified differentially expressed genes (DEGs) by integrated bioinformatics analysis. The enrichment analysis of DEGs was conducted to characterize GO and KEGG pathways. Protein-protein interaction (PPI) network and hub genes were screened via STRING and Cytoscape. CIBERSORT algorithm was utilized to analyze immune infiltration in AMs. We also verified the diagnostic and therapeutic value of hub genes.Overall, 776 DEGs were identified in AMs through bioinformatics analysis. The function enrichment analysis shed light on pathways involved in AMs. Subsequently, we screened six hub genes via PPI network. Furthermore, we evaluated immune infiltration in AMs and found that macrophages may be participating in the progression of AMs. The upregulated expression of FN1 was related to the macrophages M2 polarization. Finally, ROC analysis indicated that six hub genes had high diagnostic value for AMs and 11 drugs interacted with upregulated hub genes were identified by screening the DGIdb database.This study revealed the underlying mechanisms of pathogenesis and biological behavior of AMs and provided candidate targets for the diagnosis and treatment of AMs.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Wind发布了新的文献求助10
1秒前
2秒前
QiangZi完成签到,获得积分10
2秒前
jin_0124应助太叔静竹采纳,获得10
2秒前
斯文的慕儿完成签到,获得积分10
2秒前
miao完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
3秒前
小白完成签到,获得积分10
3秒前
制冷剂完成签到 ,获得积分10
3秒前
落无痕发布了新的文献求助20
3秒前
elena发布了新的文献求助10
3秒前
小林完成签到,获得积分10
3秒前
乐乐应助得鹿梦鱼采纳,获得10
4秒前
路边的狗尾巴草完成签到,获得积分10
4秒前
5秒前
6秒前
难过千凝完成签到,获得积分10
6秒前
neo完成签到,获得积分10
6秒前
万能图书馆应助rio采纳,获得10
7秒前
1104481279发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
Sunny完成签到,获得积分10
7秒前
8秒前
zr237618发布了新的文献求助10
8秒前
醉赏星辰完成签到 ,获得积分10
8秒前
8秒前
9秒前
Mercury发布了新的文献求助10
9秒前
迅速泽洋完成签到,获得积分10
10秒前
卷心菜完成签到,获得积分10
10秒前
领导范儿应助负责念梦采纳,获得10
10秒前
烟花应助空空采纳,获得10
10秒前
11秒前
隐形铃铛发布了新的文献求助150
11秒前
小羊发布了新的文献求助10
12秒前
木南南完成签到,获得积分10
13秒前
ddd完成签到,获得积分10
13秒前
Owen应助1104481279采纳,获得10
14秒前
彭于晏应助吖吖采纳,获得10
14秒前
高分求助中
Sustainability in Tides Chemistry 2800
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
юрские динозавры восточного забайкалья 800
English Wealden Fossils 700
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
XAFS for Everyone 500
COSMETIC DERMATOLOGY & SKINCARE PRACTICE 388
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3143174
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2794297
关于积分的说明 7810446
捐赠科研通 2450505
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1303862
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 627081
版权声明 601384