CL6mN: Rationally Designed Optogenetic Photoswitches with Tunable Dissociation Dynamics

光遗传学 麦克赫里 合成生物学 隐色素 生物物理学 化学 计算生物学 生物 生物钟 神经科学 绿色荧光蛋白 生物化学 基因
作者
Abhirup Mukherjee,Chaitanya Sudrik,Yuge Hu,Manish Arha,Mark Stathos,Jieung Baek,David V. Schaffer,Ravi S. Kane
出处
期刊:ACS Synthetic Biology [American Chemical Society]
卷期号:9 (9): 2274-2281 被引量:3
标识
DOI:10.1021/acssynbio.0c00362
摘要

The field of optogenetics uses genetically encoded photoswitches to modulate biological phenomena with high spatiotemporal resolution. We report a set of rationally designed optogenetic photoswitches that use the photolyase homology region of A. thaliana cryptochrome 2 (Cry2PHR) as a building block and exhibit highly efficient and tunable clustering in a blue-light dependent manner. CL6mN (Cry2-mCherry-LRP6c with N mutated PPPAP motifs) proteins were designed by mutating and/or truncating five crucial PPP(S/T)P motifs near the C-terminus of the optogenetic Wnt activator Cry2-mCherry-LRP6c, thus eliminating its Wnt activity. Light-induced CL6mN clusters have significantly greater dissociation half-lives than clusters of wild-type Cry2PHR. Moreover, the dissociation half-lives can be tuned by varying the number of PPPAP motifs, with the half-life increasing as much as 6-fold for a variant with five motifs (CL6m5) relative to Cry2PHR. Finally, we demonstrate the compatibility of CL6mN with previously reported Cry2-based photoswitches by optogenetically activating RhoA in mammalian cells.

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