CoADS: Cross attention based dual-space graph network for survival prediction of lung cancer using whole slide images

计算机科学 卷积神经网络 人工智能 图形 一致性 肺癌 数据挖掘 模式识别(心理学) 医学 病理 理论计算机科学 内科学
作者
Lu Zhao,Runping Hou,Haohua Teng,Xiaolong Fu,Yuchen Han,Jun Zhao
出处
期刊:Computer Methods and Programs in Biomedicine [Elsevier BV]
卷期号:236: 107559-107559 被引量:9
标识
DOI:10.1016/j.cmpb.2023.107559
摘要

Accurate overall survival (OS) prediction for lung cancer patients is of great significance, which can help classify patients into different risk groups to benefit from personalized treatment. Histopathology slides are considered the gold standard for cancer diagnosis and prognosis, and many algorithms have been proposed to predict the OS risk. Most methods rely on selecting key patches or morphological phenotypes from whole slide images (WSIs). However, OS prediction using the existing methods exhibits limited accuracy and remains challenging.In this paper, we propose a novel cross-attention-based dual-space graph convolutional neural network model (CoADS). To facilitate the improvement of survival prediction, we fully take into account the heterogeneity of tumor sections from different perspectives. CoADS utilizes the information from both physical and latent spaces. With the guidance of cross-attention, both the spatial proximity in physical space and the feature similarity in latent space between different patches from WSIs are integrated effectively.We evaluated our approach on two large lung cancer datasets of 1044 patients. The extensive experimental results demonstrated that the proposed model outperforms state-of-the-art methods with the highest concordance index.The qualitative and quantitative results show that the proposed method is more powerful for identifying the pathology features associated with prognosis. Furthermore, the proposed framework can be extended to other pathological images for predicting OS or other prognosis indicators, and thus delivering individualized treatment.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
1秒前
蓝调子完成签到,获得积分10
2秒前
3秒前
5秒前
5秒前
夏日天空发布了新的文献求助10
6秒前
lulu发布了新的文献求助10
8秒前
万能图书馆应助勤奋尔曼采纳,获得10
8秒前
babyshark发布了新的文献求助10
8秒前
YYMnice发布了新的文献求助10
9秒前
Tin发布了新的文献求助10
10秒前
zxx完成签到 ,获得积分20
11秒前
13秒前
周陆完成签到 ,获得积分10
13秒前
14秒前
CodeCraft应助段鹏鹏采纳,获得10
16秒前
16秒前
zxx关注了科研通微信公众号
16秒前
前程似锦发布了新的文献求助10
17秒前
小蘑菇应助夏日天空采纳,获得10
18秒前
wenze完成签到,获得积分10
18秒前
田様应助hero采纳,获得10
18秒前
babyshark完成签到,获得积分10
19秒前
19秒前
康大帅完成签到,获得积分10
20秒前
你没放假发布了新的文献求助10
21秒前
不安筮发布了新的文献求助10
22秒前
23秒前
小羊咩咩发布了新的文献求助10
23秒前
27秒前
科研通AI2S应助洋a采纳,获得10
27秒前
莫生完成签到,获得积分10
30秒前
32秒前
无辜尔蝶发布了新的文献求助10
32秒前
Wff完成签到,获得积分10
33秒前
Owen应助RR采纳,获得30
33秒前
洁净的静芙完成签到 ,获得积分10
33秒前
CYY发布了新的文献求助10
33秒前
37秒前
研究僧发布了新的文献求助10
38秒前
高分求助中
【此为提示信息,请勿应助】请按要求发布求助,避免被关 20000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 3000
CRC Handbook of Chemistry and Physics 104th edition 1000
Density Functional Theory: A Practical Introduction, 2nd Edition 840
J'AI COMBATTU POUR MAO // ANNA WANG 660
Izeltabart tapatansine - AdisInsight 600
Gay and Lesbian Asia 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 计算机科学 化学工程 内科学 复合材料 物理化学 电极 遗传学 量子力学 基因 冶金 催化作用
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3756737
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3300136
关于积分的说明 10112532
捐赠科研通 3014650
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1655610
邀请新用户注册赠送积分活动 790034
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 753552