Long non-coding RNA (lncRNA) MALAT1 in regulating osteogenic and adipogenic differentiation using a double-stranded gapmer locked nucleic acid nanobiosensor

长非编码RNA 脂肪生成 细胞生物学 核糖核酸 染色质 小RNA 基因表达 核酸 化学 染色质重塑 非编码RNA 生物 基因表达调控 DNA 基因 间充质干细胞 生物化学
作者
Samantha Fasciano,Shuai Luo,Shue Wang
出处
期刊:Analyst [The Royal Society of Chemistry]
卷期号:148 (24): 6261-6273 被引量:3
标识
DOI:10.1039/d3an01531a
摘要

Long non-coding RNAs (lncRNA) are non-protein coding RNA molecules that are longer than 200 nucleotides. The lncRNA molecule plays diverse roles in gene regulation, chromatin remodeling, and cellular processes, influencing various biological pathways. However, probing the complex dynamics of lncRNA in live cells is a challenging task. In this study, a double-stranded gapmer locked nucleic acid (ds-GapM-LNA) nanobiosensor is designed for visualizing the abundance and expression of lncRNA in live human bone-marrow-derived mesenchymal stem cells (hMSCs). The sensitivity, specificity, and stability were characterized. The results showed that this ds-GapM-LNA nanobiosensor has very good sensitivity, specificity, and stability, which allows for dissecting the regulatory roles of cellular processes during dynamic physiological events. By incorporating this nanobiosensor in living hMSC imaging, we elucidated lncRNA MALAT1 expression dynamics during osteogenic and adipogenic differentiation. The data reveal that lncRNA MALAT1 expression is correlated with distinct sub-stages of osteogenic and adipogenic differentiation.
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