Molecular phenotyping reveals the identity of Barrett’s esophagus and its malignant transition

食管 巴雷特食管 生物 食管腺癌 转录组 体细胞 食管癌 DNA甲基化 病理 腺癌 癌症研究 癌症 基因 医学 遗传学 解剖 基因表达
作者
Karol Nowicki-Osuch,Lizhe Zhuang,Sriganesh Jammula,Christopher W. Bleaney,Krishnaa Mahbubani,Ginny Devonshire,Annalise Katz‐Summercorn,Nils Eling,Anna Wilbrey-Clark,Elo Madissoon,John Gamble,Massimiliano di Pietro,Maria O’Donovan,Kerstin B. Meyer,Kourosh Saeb‐Parsy,Andrew D. Sharrocks,Sarah A. Teichmann,John C. Marioni,Rebecca C. Fitzgerald
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:373 (6556): 760-767 被引量:118
标识
DOI:10.1126/science.abd1449
摘要

Identifying the origin of cancer Many cancers are classified on the basis of the organ or tissue from which they originated. However, identifying the specific cells and conditions that precede tumorigenesis can help us understand and better treat the resulting disease. Nowicki-Osuch et al . used a single-cell approach to investigate the cell of origin for Barrett’s esophagus (BE) and the mechanisms leading to the development of esophageal adenocarcinoma (EAC) (see the Perspective by Geboes and Hoorens). Analyses of healthy human esophageal tissues, mutational lineage tracing, and organoid models revealed that BE originates from the gastric cardia and that EAC arises from undifferentiated BE cells. This analysis provides a map of the transcriptional landscape of the healthy esophagus that can be compared with mouse models of disease. —LMZ
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