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Exploring the Diversity of the B-Cell Receptor Repertoire Through High-Throughput Sequencing

体细胞突变 B细胞受体 生物 剧目 互补决定区 断点群集区域 DNA测序 B细胞 深度测序 计算生物学 亲和力成熟 遗传学 体细胞 抗体 免疫球蛋白轻链 分子生物学 基因 基因组 物理 声学
作者
Jennifer Hom,Deepak Tomar,Christopher Tipton
出处
期刊:Methods in molecular biology 卷期号:: 231-241 被引量:4
标识
DOI:10.1007/978-1-0716-1944-5_16
摘要

Repertoire sequencing of B cells is the high-throughput profiling of B cell receptors (BCR) expressed on the surface of B cells and of immunoglobulins (Ig) expressed by antibody secreting cells. Each BCR/Ig transcript has a unique complementarity-determining region 3 (CDR3) sequence that can be used to identify and track individual B cell lymphocytes over time and throughout different compartments of the human body. B cell differentiation can be further tracked by assessing the point mutations acquired during affinity maturation via somatic hypermutation (SHM). Here we describe a method for high-throughput sequencing of the variable region of Ig heavy-chain transcripts for repertoire analysis of human B cells on the Illumina Miseq platform.
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