STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner

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作者
Alexander Dobin,Carrie Davis,Felix Schlesinger,Jörg Drenkow,Chris Zaleski,Sonali Jha,Philippe Batut,Mark Chaisson,T Gingeras
出处
期刊:Bioinformatics [Oxford University Press]
卷期号:29 (1): 15-21 被引量:40193
标识
DOI:10.1093/bioinformatics/bts635
摘要

Motivation: Accurate alignment of high-throughput RNA-seq data is a challenging and yet unsolved problem because of the non-contiguous transcript structure, relatively short read lengths and constantly increasing throughput of the sequencing technologies. Currently available RNA-seq aligners suffer from high mapping error rates, low mapping speed, read length limitation and mapping biases.
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