The catalytic mechanism of decarboxylative hydroxylation of salicylate hydroxylase revealed by crystal structure analysis at 2.5 Å resolution

羟基化 化学 脱羧 立体化学 恶臭假单胞菌 辅因子 氨基酸 基质(水族馆) 分辨率(逻辑) 晶体结构 催化作用 生物化学 有机化学 生物 生态学 人工智能 计算机科学
作者
Takuya Uemura,Akiko Kita,Yoshihiko Watanabe,Motoyasu Adachi,Ryota Kuroki,Y. Morimoto
出处
期刊:Biochemical and Biophysical Research Communications [Elsevier]
卷期号:469 (2): 158-163 被引量:22
标识
DOI:10.1016/j.bbrc.2015.11.087
摘要

The X-ray crystal structure of a salicylate hydroxylase from Pseudomonas putida S-1 complexed with coenzyme FAD has been determined to a resolution of 2.5 Å. Structural conservation with p- or m-hydroxybenzoate hydroxylase is very good throughout the topology, despite a low amino sequence identity of 20-40% between these three hydroxylases. Salicylate hydroxylase is composed of three distinct domains and includes FAD between domains I and II, which is accessible to solvent. In this study, which analyzes the tertiary structure of the enzyme, the unique reaction of salicylate, i.e. decarboxylative hydroxylation, and the structural roles of amino acids surrounding the substrate, are considered.
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