Emergent simplicity in microbial community assembly

系统发育树 生物 16S核糖体RNA 核糖体RNA 航程(航空) 微生物种群生物学 生态学 功能(生物学) 进化生物学 细菌 古生物学 遗传学 基因 材料科学 复合材料
作者
Joshua E. Goldford,Nanxi Lu,Djordje Bajić,Sylvie Estrela,Mikhail Tikhonov,Alicia Sánchez-Gorostiaga,Daniel Segrè,Pankaj Mehta,Álvaro Sánchez
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:361 (6401): 469-474 被引量:819
标识
DOI:10.1126/science.aat1168
摘要

Interchanging species of similar function Under natural conditions, bacteria form mixed, interacting communities. Understanding how such communities assemble and stabilize is important in a range of contexts, from biotechnological applications to what happens in our guts. Goldford et al. sampled the microbial communities from soil and plants containing hundreds to thousands of sequence variants. The organisms were passaged after culture in low concentrations of single carbon sources and were cross-fed with each other's metabolites; then, the resulting communities were sequenced using 16S ribosomal RNA, and the outcomes were modeled mathematically. The mix of species that survived under steady conditions converged reproducibly to reflect the experimentally imposed conditions rather than the mix of species initially inoculated—although at coarse phylogenetic levels, taxonomic patterns persisted. Science , this issue p. 469
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