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Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells

生物 髓样 髓系细胞 细胞生物学 RNA序列 核糖核酸 细胞 计算生物学 病毒学 免疫学 遗传学 基因 基因表达 转录组
作者
Jiawei Zhang,Jinsong Shi,Liangge Wang,Xinjie Liu,Zemin Cao,Cihan Ruan,Guangzhi Ning,Shiqing Feng,Xue Yao,Shan Gao
出处
期刊:Stem Cells [Wiley]
卷期号:42 (7): 593-606
标识
DOI:10.1093/stmcls/sxae030
摘要

Abstract Cycling myeloid cells (CMCs) are often detected from various tissues using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) datasets, however, their research value was not noticed before. For the first time, our study preliminarily revealed the origin, differentiation, and roles of CMCs in physiological processes. Particularly, subgroup a of cycling myeloid cells (aCMCs) were conclusively identified as belonging to a specific cell type. In an active state, aCMCs rapidly proliferate during the early stages of an embryonic development. With an individual maturing, most aCMCs differentiate into specialized cells, while a small portion of them enter an inactive or dormant state. Under pathological conditions, aCMCs restore their proliferative and differentiation capacities via activation or revival. The present study has set the stage for future research on CMCs by linking them with progenitors of immune cells, and provided a crucial starting point to understand the origin, differentiation, and roles of CMCs in various physiological and pathological processes, particularly those related to traumatic injury, cancer, and pathogen infection, leading to develop targeted therapies or interventions.
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