Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees

系统发育树 可视化 计算机科学 系统发育关系 进化生物学 生物 人工智能 遗传学 基因
作者
Guangchuang Yu
标识
DOI:10.1201/9781003279242
摘要

Data Integration, Manipulation and Visualization of Phylogenetic Trees introduces and demonstrates data integration, manipulation and visualization of phylogenetic trees using a suite of R packages, tidytree, treeio, ggtree and ggtreeExtra. Using the most comprehensive packages for phylogenetic data integration and visualization, contains numerous examples that can be used for teaching and learning. Ideal for undergraduate readers and researchers with a working knowledge of R and ggplot2. Key Features: Manipulating phylogenetic tree with associated data using tidy verbs Integrating phylogenetic data from diverse sources Visualizing phylogenetic data using grammar of graphics
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